1 школа белокуриха: сайт МБОУ “БСОШ №1” – Главная страница

Рисунок 4. Аллель блондина в rs12821256 изменяет сайт связывания TCF/LEF и снижает LEF…

( a ) Окно размером 4 т.п.н. с центром на светлом SNP показывает, что чтения TCF7L2 ChIP-seq из проекта ENCODE накапливаются по rs12821256 в HFE размером 1,9 т.п.о. (NCBI36/hg18 chr12:87,852,100-87,853,992; набор). ( b ) Последовательность, окружающая rs12821256, напоминает консенсусный мотив связывания LEF. Ассоциированный со светлыми волосами аллель у людей заменяет высококонсервативный, совпадающий с консенсусом нуклеотид A на неконсенсусный G в пределах предсказанного мотива связывания LEF. ( с ) Ответ мини-промоторов на повышение уровня белка LEF через 48 часов после совместной трансфекции в кератиноциты HaCaT. Три протестированные репортерные конструкции люциферазы содержали 7 тандемных копий искусственного консенсусного сайта связывания LEF (7X LEF) (SuperTOPFlash), семь копий наследственного сайта связывания человека (7X ANC) или семь копий варианта последовательности, ассоциированного со светлыми волосами. (7X БЛД). Все три мини-промотора продемонстрировали повышенную активность в ответ на увеличение количества белка LEF. Величина ответа на умеренные уровни LEF соответствует предсказанным возможностям связывания вариантов сайтов LEF, с 7X LEF >> 7X ANC >> 7X BLD. Обратите внимание, что человеческий вариант 7X BLD демонстрирует значительно более низкую активацию, чем человеческая последовательность 7X ANC, при каждом испытанном уровне LEF1 (5 нг, P<0,0001; 10 нг, P<0,0001; 28 нг, P<0,0001; 50 нг, P<0,001; критерий Манна-Уитни). Показан репрезентативный эксперимент с N=2 повторениями. Столбики погрешностей указывают на с.э.м.

Рисунок 5. Линии мыши различаются по одному…

Рисунок 5. Мышиные линии, отличающиеся положением одной пары оснований в волосяном фолликуле KITLG …

Рисунок 5. Линии мышей, отличающиеся положением одной пары оснований в усилителе волосяных фолликулов KITLG , демонстрируют очевидные различия в цвете волос.

( a ) Схема стратегии сайт-специфической интеграции (SSI), использованной для создания согласованных вставок BLD-Kitlg и ANC-Kitlg у мышей. Энхансеры светлых или наследственных волос (HE) клонировали перед трансгеном минимального промотора Hsp68- Kitlg (методы). Синие стрелки обозначают фланкирующие сайты attB, которые рекомбинируют с тандемными сайтами attP (черные стрелки) в локусе мышиной хромосомы 11 h21P3 при пронуклеарной инъекции смеси, содержащей каждую плазмиду SSI с мРНК ϕC31. ( b ) Диаграммы, представляющие количественный анализ ОТ-ПЦР экспрессии РНК Kitlg в коже спины P8. Как BLD-Kitlg/+ , так и ANC-Kitlg/+ гетерозиготы демонстрируют значительно повышенные уровни эпидермального Kitlg по сравнению с контрольными животными. Однако мыши, несущие трансген светловолосого варианта, продуцируют на 21% меньше KitIg , чем соответствующие предковые трансгены. P-значения Манна-Уитни: BLD vs. +/+ = 5e-9; ANC против +/+ = 7e-10; BLD против ANC = 0,03146. ( c ) Репрезентативные 2-месячные мыши, демонстрирующие фенотипы цвета волос, связанные с одной копией каждого трансгена SSI. Мыши, изображенные слева направо, представляют собой мыши дикого типа (гибрид FVB/C57Bl/6J F1), гетерозиготы BLD-Kitlg/+, и ANC-Kitlg/+ . Мыши, несущие аллель, связанный со светлыми волосами, в rs12821256, заметно светлее, чем мыши, несущие предковый аллель в энхансере волосяных фолликулов KITLG (см. также дополнительную рис. 7).

См. это изображение и информацию об авторских правах в PMC

Похожие статьи

• Секрет натурального блонда.

  Хукстра Х. Хукстра Х. Нат Жене. 2014 июль; 46 (7): 660-1. doi: 10.1038/ng.3019. Нат Жене. 2014. PMID: 24965725

• Мелирование блондинок: тканеспецифический усилитель KITLG показывает нам, как это сделать.

  Аллен Дж. Р., де Гусман Стронг С., Джонсон С. Аллен Дж. Р. и соавт. Пигментно-клеточная меланома Res. 2014 ноябрь;27(6):1007-8. doi: 10.1111/pcmr.12311. Epub 2014 17 сентября. Пигментно-клеточная меланома Res. 2014. PMID: 25169654 Аннотация недоступна.

• Генетические детерминанты пигментации волос, глаз и кожи у европейцев.

  Сулем П., Гудбьяртссон Д.Ф., Стейси С.Н., Хельгасон А., Рафнар Т., Магнуссон К.П., Манолеску А., Карасон А., Палссон А., Торлейфссон Г. , Якобсдоттир М., Стейнберг С., Палссон С., Йонассон Ф., Сигургейрссон Б., Торисдоттир К., Рагнарссон Р., Бенедиктсдоттир К.Р., Абен К.К., Кименей Л.А., Олафссон Дж.Х., Галчер Дж., Конг А., Торстейнсдоттир У., Стефанссон К. Сулем П. и др. Нат Жене. 2007 Декабрь; 39(12):1443-52. doi: 10.1038/ng.2007.13. Epub 2007 21 октября. Нат Жене. 2007. PMID: 17952075

• Молекулярная генетика разнообразия пигментации человека.

  Штурм Р.А. Штурм РА. Хум Мол Жене. 2009 15 апреля; 18 (R1): R9-17. DOI: 10.1093/hmg/ddp003. Хум Мол Жене. 2009. PMID: 19297406 Обзор.

• Генетика пигментации кожи и волос человека.

  Паван В.Дж., Штурм Р.А. Паван В.Дж. и соавт. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2019 31 авг; 20:41-72. doi: 10.1146/annurev-genom-083118-015230. Эпаб 2019 17 мая. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2019. PMID: 31100995 Обзор.

Посмотреть все похожие статьи

Цитируется

• Генетическая история человека на Тибетском нагорье за ​​последние 5100 лет.

  Ван Х., Ян М.А., Вандуэ С., Лу Х., Чен Х., Ли Л., Донг Г., Цринг Т., Юань Х., Хэ В., Дин М., У С., Ли С., Таши Н., Ян Т., Ян Ф., Тонг И, Чен З, Хэ И, Цао П, Дай Ц, Лю Ф, Фэн Х, Ван Т, Ян Р, Пинг В, Чжан З, Гао И, Чжан М, Ван Х, Чжан С, Юань К, Ко А.М. , Альдендерфер М., Гао С., Сюй С., Фу Ц. Ван Х и др. Научная реклама 2023 15 марта; 9 (11): eadd5582. doi: 10.1126/sciadv.add5582. Epub 2023 17 марта. Научная реклама 2023. PMID: 36930720 Бесплатная статья ЧВК.

• Всесторонний обзор пигментации млекопитающих: создание инновационной косметики для изменения цвета волос.

  Фернандес Б., Кавако-Паулу А., Матама Т. Фернандес Б. и соавт. Биология (Базель). 2023 11 февраля; 12 (2): 290. doi: 10.3390/biology12020290. Биология (Базель). 2023. PMID: 36829566 Бесплатная статья ЧВК. Обзор.

• Повышенная доступность хроматина способствует эволюции транскрипционного сайленсера у Drosophila .

  Линг Л., Мюлинг Б., Джейнихен Р., Гомпель Н. Линг Л. и др. Научная реклама 2023 17 февраля;9(7):eade6529. doi: 10.1126/sciadv.ade6529. Epub 2023 17 февраля. Научная реклама 2023. PMID: 36800429 Бесплатная статья ЧВК.

• Усилители головного мозга человека de novo, созданные путем однонуклеотидных мутаций.

  Ли С., Ханненхалли С., Овчаренко И. Ли С и др. Научная реклама 2023 15 февраля;9(7):eadd2911. doi: 10.1126/sciadv.add2911. Epub 2023 15 февраля. Научная реклама 2023. PMID: 36791193 Бесплатная статья ЧВК.

• Генетика, специфичная для человека: новые инструменты для изучения молекулярной и клеточной основы эволюции человека.

  Пыльца А.А., Килик У., Лоу С.Б., Лагерь JG. Пыльца АА и др. Нат Рев Жене. 2023 фев. 3:1-25. doi: 10.1038/s41576-022-00568-4. Онлайн перед печатью. Нат Рев Жене. 2023. PMID: 36737647 Бесплатная статья ЧВК. Обзор.

Просмотреть все статьи “Цитируется по”

Типы публикаций

термины MeSH

• вещества

  Грантовая поддержка

  • R01 GM065393/GM/NIGMS NIH HHS/США
  • R01-NS050835/NS/NINDS NIH HHS/США
  • GM65393/GM/NIGMS NIH HHS/США
  • 5P50HG2568/HG/NHGRI NIH HHS/США
  • R01 NS050835/NS/NINDS NIH HHS/США
  • P50 HG002568/HG/NHGRI NIH HHS/США
  • HHMI/Медицинский институт Говарда Хьюза/США

  Полнотекстовые ссылки

  Издательская группа «Природа» Бесплатная статья ЧВК

  Укажите

  Формат: ААД АПА МДА НЛМ

  Отправить по номеру

  Естественные светлые волосы у жителей Соломоновых островов уходят корнями в родной ген, результаты исследования | News Center

  © Sergio Piumatti

  Исследователи определили ген, ответственный за светлые волосы у 5-10 процентов коренного населения Соломоновых островов в южной части Тихого океана.

  Согласно новому исследованию Медицинской школы Стэнфордского университета, частое появление светлых волос среди темнокожих коренных жителей Соломоновых островов связано с доморощенным генетическим вариантом, отличным от гена, который приводит к светлым волосам у европейцев. .

  «Это один из самых красивых на сегодняшний день примеров картирования простого генетического признака у людей», — сказал Дэвид Райх, доктор философии, профессор генетики Гарвардского университета, не участвовавший в исследовании.

  Исследование, идентифицирующее ген, ответственный за светлые волосы, на Соломоновых островах, государстве в южной части Тихого океана, представляет собой редкий случай простой генетики, определяющей внешний вид человека, и показывает важность включения недостаточно изученных групп населения в исследования по картированию генов, сказал соавтор. старший автор Карлос Д. Бустаманте, доктор философии, профессор генетики в Стэнфорде. Выводы были опубликованы 4 мая в Наука .

  «Поскольку большинство исследований в области генетики человека включают только участников европейского происхождения, у нас может быть очень предвзятое мнение о том, какие гены и мутации влияют на исследуемые нами черты. Здесь мы стремились проверить, имеет ли одна из самых ярких человеческих черт, светлые волосы, одинаковую или разную генетическую основу в разных человеческих популяциях», — сказал Бустаманте.

  Во всем мире светлые волосы встречаются редко, с достаточной частотой встречаясь только в северной Европе и в Океании, включая Соломоновы острова и соседние с ними острова. «Его частота составляет от 5 до 10 процентов на Соломоновых островах, что примерно так же, как и там, откуда я родом», — сказал соавтор Эймер Кенни, доктор философии, родившийся в Ирландии.

  Многие полагали, что светлые волосы жителей Меланезии были результатом потока генов — черта, передавшаяся европейским исследователям, торговцам и другим людям, приехавшим сюда в предыдущие века. Сами островитяне приводят несколько возможных объяснений его присутствия, сказал соавтор Шон Майлс, доктор философии, бывший стэнфордский доктор наук, ныне доцент Сельскохозяйственного колледжа Новой Шотландии. По его словам, они обычно списывают это на пребывание на солнце или на диету, богатую рыбой.

  После того, как исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Франциско получили генетические данные из образцов, Кенни, научный сотрудник лаборатории Бустаманте, начала анализ в сентябре 2010 года, на неделе, когда она начала работать в Стэнфорде. «В течение недели мы получили первый результат. Это был такой поразительный сигнал, указывающий на единственный ген — результат, на который можно положиться. Такое редко случается в науке», — сказала она. «Это был один из лучших опытов в моей карьере».

  С точки зрения генетических исследований анализ был простым, сказал Кенни. Но сбор данных, выполненный в 2009 г.Майлза и соавтора Николаса Тимпсона, доктора философии, было сложнее. Большая часть Соломоновых островов не застроена, без дорог, электричества и телефонов. Это также одна из самых лингвистически разнообразных наций в мире, где говорят на десятках языков.

  Это была обратная поездка Майлза, который был там в 2004 году в качестве аспиранта у молекулярного антрополога Института Макса Планка Марка Стоункинга, доктора философии (также соавтора исследования), чтобы выяснить, коррелируют ли языковые вариации с генетическими вариациями. . Находясь там, Майлз был очарован повсеместностью светлых волос, которые были особенно распространены среди детей.

  © Sean Myles

  Исследователи из Стэнфорда говорят, что были удивлены тем, что доказательства так убедительно указывали на единственный ген, отвечающий за светлые волосы у жителей Соломоновых островов. Дополнительные фотографии доступны здесь.

  «У них очень темная кожа и яркие светлые волосы. Это было ошеломляюще», — сказал Майлз. «Как генетик на пляже, наблюдая за играющими детьми, вы подсчитываете количество детей со светлыми волосами и говорите: «Ого, это от 5 до 10 процентов».

  Грант от Фонда антропологических исследований Веннера-Грена. дал Майлзу, который в то время работал научным сотрудником в Корнельском университете, шанс изучить генетику цвета волос жителей Соломоновых островов. Майлз работал с Бустаманте, который также работал в Корнелле, над разработкой исследования. Вернувшись на острова, Майлз и Тимпсон ходили из деревни в деревню, объясняя, что они хотят делать, и просили разрешения на сбор данных. Майлз говорил на пиджине Соломоновых островов, наиболее широко распространенном языке.

  Когда местный вождь дал добро, исследователи набрали участников и оценили цвет волос и кожи с помощью измерителя отражения света, сняли показания артериального давления и измерили рост и вес. Они попросили жителей деревни сплюнуть в маленькие пробирки, чтобы получить слюну, которую можно использовать для выделения ДНК. В течение месяца они собрали более 1000 образцов.

  В то время как острова соответствуют представлениям многих людей о тропическом рае, на них отсутствуют удобства, которые жители Запада считают само собой разумеющимися. Например, просто найти ровное место для весов для взвешивания участников исследования было непростой задачей.

  Затем, в 2010 году, Бустаманте присоединился к профессорско-преподавательскому составу Стэнфорда, и при финансовой поддержке Департамента генетики команда искала гены, лежащие в основе этого поразительного фенотипа. Вскоре после этого Кенни присоединился к лаборатории и начал анализ, выбрав 43 светловолосых и 42 темноволосых жителя Соломоновых островов из противоположных 10-процентных пределов диапазона пигментации волос. Она использовала их в исследовании ассоциации всего генома, методе выявления различий в частоте генетических вариантов между двумя группами, для чего обычно требуются тысячи образцов.

  Карлос Бустаманте

  Поскольку подавляющее большинство физических характеристик человека, проанализированных на сегодняшний день, имеют множество генетических факторов и факторов окружающей среды, Кенни ожидал неубедительного результата, который потребует дальнейшего изучения. Вместо этого она сразу же увидела один сильный сигнал на хромосоме 9, на долю которого приходилось 50 процентов дисперсии цвета волос жителей Соломоновых островов.

  Команда исследователей определила ответственный ген TYRP1 , , который кодирует родственный тирозиназе белок 1, фермент, ранее признанный влияющим на пигментацию у мышей и людей. Дальнейшие исследования показали, что конкретный вариант, ответственный за светлые волосы на Соломоновых островах, отсутствует в геномах европейцев.

  «Таким образом, свойство светлых волос человека независимо возникло в экваториальной Океании. Это довольно неожиданно и увлекательно», — сказал Кенни.

  Открытие подчеркивает важность генетических исследований изолированных популяций, сказал Бустаманте. «Если мы собираемся разработать следующее поколение медицинских препаратов с использованием генетической информации, и у нас нет действительно широкого спектра населения, вы можете непропорционально принести пользу одним группам населения и нанести вред другим».

  Бустаманте ищет финансирование для анализа остальных собранных данных. «Например, генетика пигментации кожи там тоже может быть другой — не такой, как в Европе, Африке или Индии. Мы просто не знаем».

  Дополнительными соавторами были Стэнфордские постдокторанты Мартин Сикора, доктор философии, и Андрес Морено Эстрада, доктор философии; Стажер-исследователь из Стэнфорда Мух-Чинг Йи, доктор философии; и исследователи из UCSF, в том числе профессор биоинженерии, терапевтических наук и медицины Эстебан Гонсалес Бурхард, доктор медицины. Николас Тимпсон в настоящее время преподает в Бристольском университете, Великобритания.