МБОУ “СОШ №57” г. Кирова
С 6 июля 2021 года начинается приема заявлений о приеме на обучение в первый класс от граждан, не проживающих на закрепленной за общеобразовательной организацией территории. По состоянию на 7 июля свободные места для приема в 1 классы отсутствуют.
Прием заявлений в 10 класс будет проходить 24 июня с 17 до 19 часов в кабинете директора. Заявление пишут родители (законные представители) в присутствии ребенка. При себе иметь аттестат за 9 класс, паспорта (родителя и ребенка). В заявлении необходимо будет Читать далее …
Видеоролики (смотреть)
Собрания родителей будущих первых классов состоятся 31 мая (понедельник) в 18.00 1а – кабинет № 28 (кл. руководитель Чимбир Т.В.) 1б – кабинет № 21 (кл. руководитель Шубина М.А.) 1в – кабинет № 23 (кл. руководитель Бузмакова Е.А.) 1г – Читать далее …
Голосование по отбору общественных территорий для благоустройства На территории муниципального образования «Город Киров» голосование по отбору общественных территорий, подлежащих благоустройству в 2022 году в рамках реализации муниципальной программы «Формирование современной городской среды муниципального образования «Город Киров» на 2020 – 2024 годы» Читать далее …
Информация (буклет)
с 1 апреля по 28 мая: пн: 15. 00-17.00 вт: 15.00-18.30 ср: 15.00-17.00 чт: 15.00-17.00 пт: 12.00-14.00
Собрание родителей состоится 30 марта (вторник) 18.00. Место проведения: рекреация 2 этажа школы. Обязателен масочный режим.
1. Очный образовательный процесс приостанавливается: — для учащихся 1-4 классов при температуре воздуха на улице -25 градусов и ниже, — для учащихся 1-8 классов при температуре воздуха на улице -30 градусов и ниже, — для учащихся 1-11 классов при температуре Читать далее …
Киров школа 37 электронный журнал
Киров школа 37 электронный журнал
Вход в систему / Eljur hello. Уважаемые пользователи! Чтобы осуществить вход в электронный журнал своей школы, необходимо знать адрес (доменное. МОАУ СОШ с УИОП №37 г. Кирова Сила в //info.43edu.ru/ или сайт электронной отчетности В связи с проведением в школе ЕГЭ и ОГЭ лагерь работает : 04 июня, 05 июня. Бухгалтерия. Бухгалтерам небольших компаний для ведения бухгалтерии, расчета зарплаты и сдачи отчетности через интернет. Как открыть электронный дневник школы 37 Киров? В статье читайте как получить доступ в электронный дневник 37 школы города Электронный журнал Школа. Монтессори материалы. Мария Монтессори разработала специальные материалы, которые служат ребёнку инструментом для саморазвития психики. МОАУ СОШ с УИОП №37 г. Кирова. Информационно-аналитическая система «ЭЛЕКТРОННЫЙ КЛАССНЫЙ ЖУРНАЛ», родителям и администрации школы наблюдать ход. О Системе Госфинансы Система Госфинансы – это справочная система, созданная специально для бухгалтеров и экономистов бюджетных, казенных и автономных учреждений. Школа № 37 г.Киров. ВЕЧЕР ВСТРЕЧИ ВЫПУСКНИКОВ ШКОЛЫ №37 в клубе led _____ connecting people Добавляйте фотографии из школы, фотографии учителей. n п/п . Наименование раздела . i . Оценка пожарного риска, обеспеченного на объекте защиты не производится, так как выполняются требования федеральных законов МБОУ ООШ №33 города Кирова.
Электронный дневник Киров – вход в систему Дневник.ру
На нашем портале школьники и их родители могут найти инструкцию о том, как войти в электронный дневник и журнал города Киров Кировской области такой системы как Дневник.ру.О системе образования
Дневник.ру, Сетевой город и АСУ РСО представляет интернет-ресурс, включающий цифровой журнал успеваемости и дневник. Благодаря системе можно наладить дистанционное общение между всеми участниками образовательного процесса. Сервис позволит родителям постоянно быть в курсе успеваемости детей. Учителя могут проводить различные виды мониторинга и корректировать учебный план в соответствии с результатами. Есть несколько причин, по которым портал рекомендуют для апробации электронных средств контроля успеваемости учащихся. Портал dnevnik.ru зарегистрирован официально в качестве оператора персональной информации. Каждый участник имеет собственный логин и пароль для входа в систему. Эти данные генерируются автоматически школьными администраторами, ведущими портал. Никто посторонний не может узнать конфиденциальной информации. Система является полностью бесплатной. Для использования ресурса нужен только компьютер со стабильно работающим интернетом. Не нужно устанавливать дополнительных приложений.
Информационный портал используется для организации общей информационно-образовательной сети, объединяющей учителей, администрацию школы, родителей и учеников. Система является удобным ресурсом взаимодействия, соответствует современным образовательным тенденциям. Пользователь с доступом получает всю интересующую информацию. Ресурс позволяет реализовать такие возможности, как ведение цифрового журнала и дневника, запись заданий на дом и много другое. Для общения участников образовательного процесса в «Дневнике» адаптированы основные функции соцсетей.
Родителям цифровой дневник помогает наладить продуктивное сотрудничество с образовательной организацией, в которой обучается ребёнок. Здесь можно узнать о различных мероприятиях и школьных событиях, узнать новости, расписание занятий и задание на дом. С помощью данного проекта родители могут не только контролировать успеваемость, но и посещение занятий. Учащиеся могут свободно просматривать собственные оценки, расписание и домашнее задание. Они также могут видеть объявления о проводимых мероприятиях. Система показывает рейтинг и статистику по оценкам за определённый временной промежуток. Это мотивирует учеников на улучшение или закрепление имеющихся результатов. Таким образом портал способствует заинтересованности в получении знаний и вовлечению в школьную жизнь.
Вход в систему
Для того, чтобы войти в систему образование электронного дневника и журнала Дневник.ру Киров, Вам необходимо перейти по ссылке ниже:
Войти в Дневник
Список школ и учреждений
Список школ
- КОГАОУДОД «ВятОСДЮСШОР»
- КОГАОУ ДОД «ДЮСШ «Юность»
- КОГАОУДОД «СДЮСШОР «Динамо» имени ЗМС М.Г. Исаковой
- КОГАОУ ДОД ДЮСШ «Богатыри»
- КОГАОУ ДОД СДЮСШОР
- КОГОБУ СОШ ЦДОД
- Кировская специальная (коррекционная) общеобразовательная школа-интернат I вида
- МБОУ ДОД «ДХШ» г.Кирова
- МБОУ ООШ № 33 г. Кирова
- МБОУ СОШ №16 города Кирова
- МБОУ «СОШ № 70» города Кирова
- МБОУ школа № 51
- МБОУДОД «ЛДШИ» г. Кирова
- МБОУ ДОД «ДШИ «Рапсодия» г.Кирова
- МБОУДОД «ДМШ № 2» г. Кирова
- МБОУДОД «ДМШ № 4» г. Кирова
- МБОУДОД «ДШИ «Фольклорная» г. Кирова
- МБОУ ДОД «ДШИ «Элегия» г.Кирова
- МБОУДОД «ДШИ №11» г. Кирова
- МБОУ ДОД «ДШКТ»
- МОАУ ДОД ДЮСШ № 6 г. Кирова
- ДЮСШ № 2 г. Кирова
- ДЮСШ № 4 г. Кирова
- МБОУ ДОД «НДШИ» г. Кирова
- МБОУДОД «ПДМШ» г. Кирова
- МБОУ ДОД «РДШИ» г. Кирова
- СДЮСШОР № 1
- СДЮСШОР № 3
- МБОУ ДОД СДЮСШОР № 8 города Кирова
- МБОУ СОШ № 30 г. Кирова
- МБОУ основная школа № 24 г. Кирова
- МОАУ СОШ № 20
- МБОУ СОШ № 56 города Кирова
- МБОУ «СОШ № 57» города Кирова
- МБОУ «СОШ с УИОП № 66» города Кирова
- вечерняя школа № 7
- МБОУ ООШ №39 г. Кирова
- МБОУ СОШ № 32 города Кирова
- МБОУ «СОШ №53» г. Кирова
- МБОУ СОШ № 2 города Кирова
- МБОУ СОШ № 22
- МБОУ СОШ № 31 г. Кирова
- МБОУ СОШ №40 г. Кирова
- МБОУ СОШ № 54 г. Кирова
- школа № 59
- МБОУ «СОШ № 71» города Кирова
- МБОУ СОШ № 73 г. Кирова
- МБОУ «СОШ № 42» города Кирова
- МБОУ СОШ №45 им. А.П. Гайдара г. Кирова
- МБОУ «СОШ с УИОП № 58» города Кирова
- МБОУ средняя школа № 27 города Кирова
- МБОУ СОШ с УИОП № 48 г. Кирова
- МБОУ СОШ с УИОП № 52 города Кирова
- МБОУ «СОШ с УИОП №61» города Кирова
- МБОУ СОШ с УИОП № 62 им. А.Я. Опарина г. Кирова
- школа № 65
- МБОУ средняя школа № 74 города Кирова
- МКОУ НОШ № 35 «Ступени» города Кирова
- Школа-интернат № 1 г. Кирова
- МКОУ СОШ № 34 города Кирова
- МКОУ СКОШ №13 города Кирова
- С(К) ОШ № 44
- начальная школа-детский сад № 5 «Хрусталик»
- МКОУ СКОШ № 50 г. Кирова
- МКС(К)ОУ школа № 67 г. Кирова
- МКС(К)ОУ школа-интернат № 3 города Кирова
- МОАУ ДОД ДЮСШ № 5
- МОАУ СОШ с УИОП № 37 г. Кирова
- МОАУ СОШ с УИОП № 60 города Кирова
- МОАУ СОШ №18 г. Кирова
- МОАУ СОШ № 8 г. Кирова
- МОАУ СОШ №14 города Кирова
- МОАУ СОШ с УИОП № 47 города Кирова
- МОАУ средняя школа № 9 г. Кирова
- МОАУ СОШ с УИОП №10 г. Кирова
- МОАУ СОШ №28 г. Кирова
О городе
Киров — это довольно крупный город в России, расположенный на реке Вятка (896 км от Москвы). Численность населения города равна 464 тысячам человек. Киров считается «меховой» и «торфяной» столицей России. Раньше Киров имел название Хлынов, которое имело различные значения. Среди них наиболее известными были крик птиц, живущих в той местности : «хлыв-хлыв»; от названия реки Хлыновицы, впадающей в реку Вятка или от слова «хлын», означавшего «речной разбойник». Затем Киров стал называться Вяткой. Здесь существуют различные точки зрения о происхождении этого названия, в том числе от населявшей местность группы удмуртов, которая называлась Ватка; от названия народов вяда, которые были тесно связаны с удмуртами и более популярная точка зрения : от названия реки, означавшей — «большая». Последнее укоренившееся название — «Киров» город получил не так давно — в 1934 году. Произошло оно он имени участника Октябрьской революции — Кирова. В настоящее время в городе существует движение с названием «Наша Вятка». Сторонники этого движения требуют возвращения городу его предыдущего названия. Городская дума рассматривает этот вопрос. По уставу город имеет три символа: герб города, гимн города, флаг города. На гербе Кирова изображен лук со стрелой и держащая его рука. В верхней части герба изображен красный крест. Сам герб желтого цвета. Золотой цвет символизирует богатство, чистоту, верность, силу, милосердие и смирение. Красный цвет, присутствующий на гербе означает храбрость и мужество. Лазурный цвет — знак великодушия и верности, честности и безупречности.
Другие города области
Главная » Главная страница
|
|
Вакантные места для приема (перевода)
Уважаемые родители!
Получение общего образования (реализация основных общеобразовательных программ начального общего, основного общего, среднего общего образования, в том числе обучение по адаптированным основным образовательным программам) – бесплатное, за счет бюджетных ассигнований Кировской области и муниципального образования “Город Киров”.
На данной владке Вы можете узнать: в каких классах и какое количество вакантных мест для приема (перевода) имеется в школе. При наличии вакантных мест, Вы можете подать заявление о приеме (переводе) ребенка для обучения в школе.
Родителям (законным представителям) может быть отказано в приеме в школу только по причине отсутствия вакантных мест.
В таблице “Наличие вакантных мест” указываются только те классы, где имеются свободные места (контингент обучающихся).
Родители (законные представители) имеют право выбора образовательного учреждения.
Вакантные места для приема (перевода) учащихся на 05.07.2021 (2021-2022 учебный год)
Параллель | а | б | в | г | д | Итого |
4 класс | 1 | 1 | ||||
5 класс | 1 | 1 | 2 | 4 | ||
9 класс | 7 | 1 | 8 | |||
10 класс | 6 | 6 | ||||
Всего | 6 | 9 | 2 | 2 | 19 |
Вакантные места для приема в первые классы (2021-2022 учебный год) на 26. 04.2021
Класс | Фамилия, имя, отчество классного руководителя | План приема | Подано заявлений | Вакантные места |
1а | Брагина Наталья Васильевна | 25 | 25 | 0 |
1б | Яровикова Екатерина Владимировна | 25 | 25 | 0 |
1в | Едигарева Елена Сергеевна | 25 | 25 | 0 |
1г | Пушкарева Наталья Александровна | 25 | 25 | 0 |
4 | Всего | 75 | 100 | 0 |
Литеры классов, классные руководители назначены произвольно. Уточнение классных руководителей, литеры классв, зачисление обучающихся будет проведено при распределении обучающихся по классам не ранее 01 июля 2021, но не позднее 03 июля 2021 года. Зачисление для обучения в первые классы проведено.
Прием заявлений в первые классы может быть прекращен ввиду отсутствия мест для приема в школу. По вопросам приема детей в школу можно обратиться в департамент образования администрации города Кирова: 610017, г. Киров, ул. Молодая Гвардия, д. 74. Тефефон: +7(8332) 70-80-98, 35-03-35, 35-84-57.
Ближайшая школа микрорайона: муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение “Средняя общеобразовательная школа с углубленным изучением отдельных предметов № 65” города Кирова: г. Киров, Нововятский район, ул. Советская, д. 168. Телефон: +7(8332) 31-78-13, 31-91-83.
О дате создания образовательного учреждения (государственной регистрации образовательного учреждения) | |
О структуре образовательного учреждения, в том числе: | |
наименование учредителя образовательного учреждения, | департамент образования Кировской области |
его место нахождение | 610019, город Киров, ул. Карла Либкнехта, дом № 69 |
график работы, | |
справочный телефон | (8332) 38-18-46 |
адрес сайта в сети Интернет, | http://www.43edu.ru |
Адрес электронной почты; | [email protected] |
Руководитель КОГОБУ СОШ с УИОП г. Омутнинска, | Наталья Петровна Локтина |
его место нахождения | 612740, обл.Кировская, г.Омутнинск, ул.Комсомольская,д. 38, каб. (3 этаж) |
график работы, | Пн-Чт: с 9-00 до 18-00 Пт: c 9-00 до 17-00 |
справочный телефон, | 7-83352-22241 |
адрес электронной почты | [email protected] |
О реализуемых основных и дополнительных образовательных программах с указанием численности лиц, обучающихся за счет средств соответствующего бюджета бюджетной системы Российской Федерации, по договорам с физическими и (или) юридическими лицами с оплатой ими стоимости обучения | |
О персональном составе педагогических работников (фамилия, имя, отчество, занимаемая должность, уровень образования, квалификация, наличие ученой степени, ученого звания) | Скачать: pdf |
О материально-техническом обеспечении и оснащенности образовательного процесса (в том числе о наличии библиотеки, общежитий, спортивных сооружений, об условиях питания, медицинского обслуживания, о доступе к информационным системам и информационно-телекоммуникационным сетям) с указанием перечня зданий, строений, сооружений, помещений и территорий, используемых для осуществления образовательного процесса, их адресов и назначения | Скачать: .pdf |
Об электронных образовательных ресурсах, доступ к которым обеспечивается обучающимся | См. раздел сайта: “Учителям=Образовательные ресурсы” |
О поступлении и расходовании финансовых и материальных средств по итогам финансового года | Скачать: pdf |
№ | Образовательное учреждение | Наименование продукта |
1 | МОАУ экономики и права | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
2 | МОУ лицей естественных наук | АИАС “АВЕРС:Директор” |
3 | МОУ физико-математический лицей | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотка” |
4 | МОУ Вятский технический лицей | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
5 | МОУ СОШ с УИОП №3 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
6 | МОУ СОШ №8 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
7 | МОУ СОШ №14 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
8 | МОУ СОШ №16 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
9 | МОУ СОШ №18 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
10 | МОУ СОШ с УИОП №20 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
11 | МОУ СОШ №24 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” |
12 | МОУ СОШ с УИОП №28 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
13 | МОУ СОШ №40 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” |
14 | МОУ СОШ с УИОП №42 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
15 | МОУ СОШ с УИОП №47 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” |
16 | МОУ СОШ с УИОП №49 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
17 | МОУ СОШ с УИОП №51 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
18 | МОУ СОШ № 57 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” |
19 | МОУ СОШ с УИОП №58 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” |
20 | МОУ СОШ с УИОП №65 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Электронный классный журнал” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
21 | МОУ СОШ с УИОП №66 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
22 | МОУ СОШ с УИОП №70 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
23 | МОУ СОШ с УИОП №71 | АИАС “АВЕРС:Директор” АИАС “АВЕРС:Расписание уроков” АИАС “АВЕРС:Библиотека” |
24 | ||
25 | ||
Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie
Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности. Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.
Настройка вашего браузера для приема файлов cookie
Существует множество причин, по которым cookie не может быть установлен правильно. Ниже приведены наиболее частые причины:
- В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки своего браузера, чтобы он принимал файлы cookie, или чтобы спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
- Ваш браузер спрашивает вас, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались. Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, нажмите кнопку «Назад» и примите файлы cookie.
- Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Если вы подозреваете это, попробуйте другой браузер.
- Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г., браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы исправить это, установите правильное время и дату на своем компьютере.
- Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie. Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.
Почему этому сайту требуются файлы cookie?
Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу. Чтобы предоставить доступ без файлов cookie потребует, чтобы сайт создавал новый сеанс для каждой посещаемой страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.
Что сохраняется в файле cookie?
Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в cookie; никакая другая информация не фиксируется.
Как правило, в файлах cookie может храниться только информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта. Например, сайт не может определить ваше имя электронной почты, пока вы не введете его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступа к остальной части вашего компьютера, и только сайт, который создал файл cookie, может его прочитать.
М.И. Аройо, Дж. М. Пересмато, К. Капиллас, Э. Кроумова, С. Иванчев и др., Реферат, Zeitschrift для кристаллографии – кристаллические материалы, том 57, выпуск 1, стр.15-27, 2006.
DOI: 10.1107 / S0108767300018973
М. И. Аройо, А. Киров, К. Капиллас, Дж. М. Пересмато и Х. Вондрачек, Кристаллографический сервер Бильбао. II. Представления кристаллографических точечных групп и пространственных групп, Acta Crystallographica, раздел A «Основы кристаллографии», вып.62, выпуск 2, стр.115-128, 2006.
DOI: 10.1107 / S0108767305040286
M. I. Aroyo, J. M. Perez-mato, D. Orobengoa, E. S. Tasci, G. De-la-flor et al., Кристаллография онлайн: Bilbao Crystallographic Server, Bulgarian Chemical Communications, том 43, стр. 183-197, 2011.
Х. Бернигхаузен, Отношения группа-подгруппа между пространственными группами: полезный инструмент в кристаллохимии, MATCH, Communications in Mathematical Chemistry, vol.9, pp.139-175, 1980.
А. Бельский, М. Хелленбрандт, В.Л. Карен и П. Лукш, Новые разработки в базе данных неорганических кристаллов (ICSD): доступность для поддержки исследований и проектирования материалов, Acta Crystallographica Section B Structural Science, vol.58, issue 3, pp.364-369 , 2002.
DOI: 10.1107 / S0108768102006948
H. Brandt, ??? ber eine Verallgemeinerung des Gruppenbegriffes, Mathematische Annalen, том 96, выпуск 1, стр. 360-366, 1927.
DOI: 10.1007 / BF01209171
М. Дж. Бюргер, Производные кристаллические структуры, Журнал химической физики, вып.20, вып.1, стр.1-16, 1947.
DOI: 10.1073 / pnas.20.7.444
К. Капиллас, Э. С. Таши, Г. Де-ла-флор, Д. Оробенгоа, Дж. М. Пересмато и др., Новый компьютерный инструмент на кристаллографическом сервере Бильбао для обнаружения и характеристики псевдосимметрии, Zeitschrift f ?? r Kristallographie, vol.37, issue.2, pp.186-196, 2011.
DOI: 10.1006 / jssc.1994.1334
К. Дорнбергер-Шифф, Неупорядоченные структуры порядка ??? (OD-структуры), Acta Crystallographica, том 9, выпуск 7, стр. 593-601, 1956.
DOI: 10.1107 / S0365110X56001625
URL: http://journals.iucr.org/q/issues/1956/07/00/a01751/a01751.pdf
К. Дорнбергер-шифф, Grundzüge einer Theorie von OD – Strukturen aus Schichten, Abhandlungen der Deutschen Akademie der Wissenschaften, Klasse für Chemie, p.107, 1964.
Г. Фридель, Leçons de Cristallographie, стр. 602, 1926.
Б. А. Хаусманн, О. Оре, Теория квазигрупп, Американский журнал математики, том 59, выпуск 4, стр. 983–1004, 1937.
DOI: 10.2307/2371362
Э. Хеллнер, Структурная схема сульфидных минералов, Журнал геологии, том 66, выпуск 5, стр. 503-525, 1958.
DOI: 10.1086 / 626532
Т. Ито и Х. Мураокуа, Накасит, новый андоритоподобный минерал, Zeitschrift f ?? r Kristallographie, vol.113, issue.1-6, pp.94-98, 1960.
DOI: 10.1524 /zkri.1960.113.1-6.94
Э. Кох, В. Фишер, У. Мюллер, Нормализаторы главы космической группы, Симметрия космической группы, 2005.
Э. Маковицкий и В.Г. Мамме, Кристаллическая структура рамдохрита, Pb 6 Sb 11 Ag 3 S 24, и ее значение для группы андорита и цинкенита, Neues Jahrbuch für Mineralogie. Abhandlungen, vol.147, pp.58-79, 1983.
Я. Моэло, Э. Маковицки и С. Каруп-Меллер, Серные комплексы пломбо-агенты: минералогия и кристаллохимия серии андорит-физелит, Cu) x (Sb, Bi, As) 2 + x (S, Se) 6. Documents du BRGM, 167. Éditions du BRGM, 1989.
К. Момма и Ф. Идзуми: система трехмерной визуализации для электронного и структурного анализа, Журнал прикладной кристаллографии, вып.41, выпуск 3, стр.653-658, 2008.
DOI: 10.1107 / S0021889808012016
М. Несполо, Математическая кристаллография все еще играет роль в XXI веке? : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00200861
М. Несполо и Дж. Феррарис, Двойникование по сингонической и метрической мероэдрии. Анализ, классификация и влияние на дифракционную картину, Zeitschrift f ?? r Kristallographie – Crystalline Materials, vol.214, выпуск 2, стр.77-81, 2000.
DOI: 10.1524 / zkri.1999.214.7.378
М. Несполо, Г. Феррарис, С. Фурови и Я. Такеучи, Реферат, Zeitschrift f ?? r Kristallographie – Crystalline Materials, vol.91, issue.12, pp.773-778, 2004.
DOI : 10.1016 / 0022-4596 (74)
-9
М. Несполо и Г. Феррарис, Обзор гибридных близнецов в несиликатных минералах, Европейский журнал минералогии, том 21, выпуск 4, стр. 673-690, 2009.
DOI: 10.1127 / 0935-1221 / 2009 / 0021-1937
URL: https: // hal.archives-ouvertes.fr/hal-01711519
А. К. Норт, Д. С. Филлипс и Ф. С. Матеус, Полуэмпирический метод коррекции поглощения, Acta Crystallographica Section A, vol.24, issue 3, pp.351-359, 1968.
DOI: 10.1107 / S0567739468000707
Органова Н.И., Кузьмина О.В., Бортников Н.С., Мозгова Н.Н. Кристаллическая структура субъячейки синтетического андорита-24 // Доклады Академии Наук СССР, 1982, т. 267, с. 939-942.
В. Петричек, М. Дусек и Л. Палатинус, Яна 2006.Кристаллографическая вычислительная система, Институт физики, 2006.
Р. Саданага, Т. Савада, К. Осуми и К. Камия, Классификация надстроек по симметрии, Журнал структурных отношений и псевдосимметрий в андорите Японская ассоциация минералогов, петрологов и экономических геологов, стр. 23-29, 1980 .
Я. Такеучи, Тропохимическое двойникование клеток: структура – механизм построения в кристаллических твердых телах, 1997.
Х. Вондратчек, Расщепление позиций (орбит) Вайкоффа, минералогия и петрология, стр.87-96, 1993.
Х. Янг, Р. Т. Даунс, Дж. Б. Берт и Г. Костин, УТОЧНЕНИЕ СТРУКТУРЫ НЕПРЕРЫВНОГО ОДНОГО КРИСТАЛЛА ИЗБЫТОЧНОГО ФИЗЕЛИИТА Ag5.94Pb13.74Sb20.84S48, The Canadian Mineralogist, том 47, выпуск 5, стр. .1257-1264, 2009.
DOI: 10.3749 / canmin.47.5.1257
Медицинские и нейроповеденческие фенотипы у носителей генетических делеций, связанных с X-связанным ихтиозом, в Британском Биобанке
Реферат
Предпосылки X-связанный ихтиоз (XLI) – это необычное дерматологическое состояние, возникающее в результате дефицита фермента стероидной сульфатазы ( STS), часто вызываемые X-связанными делециями, охватывающими STS .Некоторые сопутствующие медицинские заболевания были выявлены в случаях XLI, но небольшая выборка относительно молодых пациентов ограничила это. STS высоко экспрессируется в подкорковых структурах мозга, и мужчины с делециями XLI и женщины имеют повышенный риск развития / расстройств настроения и связанных с ними черт; нейрокогнитивная основа этих результатов не исследовалась.
Методы Используя ресурс UK Biobank, включающий участников в возрасте 40–69 лет, набранных из общей популяции Великобритании, мы сравнили несколько медицинских / нейроповеденческих фенотипов у мужчин (n = 86) и женщин (n = 312), несущих генетические делеции, охватывающие СТС (0.8–2,5 Mb) (случаи) мужчинам (n = 190 577) и женщинам (n = 227 862), не являющимся носителями.
Результаты Мы определили повышенную частоту фибрилляции / трепетания предсердий у мужчин-носителей делеций (10,5% против 2,7% у мужчин контрольной группы, поправка Бенджамини-Хохберга, p = 0,009) и повышенная частота психических расстройств (p = 0,003). раздражительность (p <0,001) и депрессивно-тревожные черты (p <0,05) у мужчин-носителей делеций по сравнению с мужчинами контрольной группы, заполнившими анкету по психическому здоровью. В то время как академическая успеваемость не пострадала, носители делеции мужского и женского пола демонстрировали снижение успеваемости в тесте жидкого интеллекта (d≤0.05, исправлено p <0,1). Нейроанатомический анализ у женщин-носителей делеции показал уменьшение объемов правой скорлупы и прилежащего левого ядра (d≤0,26 по Коэну, скорректированный p <0,1).
Заключение Взрослые мужчины с делециями XLI, по-видимому, имеют повышенный риск сердечных аритмий и проблем с настроением, о которых они сообщают сами; измененная структура базальных ганглиев может лежать в основе измененных функций и связанных с XLI психиатрических / поведенческих фенотипов. Эти результаты предоставляют информацию для генетического консультирования лиц с делециями и подтверждают потребность в многопрофильной медицинской помощи.
- аритмии
- номер копии
- дерматология
- психиатрия
- нейробиология
Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с лицензией Creative Commons Attribution 4.0 Непортированная (CC BY 4.0) лицензия, которая позволяет другим копировать, распространять, ремикшировать, преобразовывать и строить эту работу для любых целей, при условии, что оригинальная работа правильно процитирована, дана ссылка на лицензию и указание того, были ли изменения сделали.См. Https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/.
Вариация числа копий и психоневрологические заболевания
Curr Opin Genet Dev. 2021 июн; 68: 57–63.
MRC Center for Neuropsychiatric Genetics and Genomics, Division of Psychological Medicine and Clinical Neuroscities, School of Medicine, Cardiff University, Cardiff, United Kingdom
Это статья в открытом доступе под лицензией CC BY (http://creativecommons.org /licenses/by/4.0/).
Эта статья цитируется в других статьях в PMC.Графический реферат
Идентификация нервно-психических расстройств. A) Схема удаления и дупликации. B) Пример локуса, обогащенного делециями в случаях. C) Количество CNV риска, участвующих в опубликованных исследованиях нервно-психических расстройств. Количество случаев, включенных в каждое исследование, показано на оси x, а более крупные точки представляют исследования с большим количеством контрольных образцов (более подробную информацию см. В Таблице 1). SCZ = шизофрения, ASD = расстройство аутистического спектра, ID = умственная отсталость, MDD = большое депрессивное расстройство, ADHD = синдром дефицита внимания и гиперактивности, TS = синдром Туретта, OCD = обсессивно-компульсивное расстройство, BD = биполярное расстройство.
Abstract
Варианты числа копий (CNV) в определенных локусах были определены как важные факторы риска для ряда психоневрологических расстройств, таких как шизофрения, расстройство аутистического спектра, умственная отсталость (ID) и депрессия. Эти CNV индивидуально редки (частота <0,5%), имеют высокий размер эффекта и показывают плейотропные эффекты при множественных психоневрологических расстройствах, что подразумевает общую этиологию. Нейропсихиатрические CNV также связаны с когнитивными нарушениями и другими заболеваниями, такими как пороки сердца и ожирение.Поскольку большинство нейропсихиатрических CNV являются мультигенными, было сложно сопоставить их влияние на конкретные биологические процессы, хотя анализ набора генов выявил гены, связанные с регуляцией синапса и хроматина. Однако будущие исследования полногеномного секвенирования имеют потенциал для выявления новых ассоциаций CNV с одним геном, которые могут дать представление о патофизиологии, лежащей в основе нейропсихиатрических расстройств.
Current Opinion in Genetics and Development 2021, 68 : 57–63
Этот обзор взят из тематического выпуска Молекулярно-генетические основы болезни
Под редакцией Дженнифер Глэдис Малл , Патрик Ф. Sullivan и Jens Hjerling-Leffler
Полный обзор см. В выпуске и редакционной статье
Доступно онлайн 19 марта 2021 года
https: // doi.org / 10.1016 / j.gde.2021.02.014
0959-437X / © 2021 Авторы. Опубликовано Elsevier Ltd. Это статья в открытом доступе по лицензии CC BY (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/).
Введение
Варианты числа копий (CNV) представляют собой структурные перестройки хромосом и представляют собой основной источник генетической изменчивости [1,2 ••]. CNVs включают в себя прирост и потерю сегментов ДНК, соответственно известные как дупликации и делеции. Другие формы структурных вариантов включают инверсии, которые меняют последовательность сегмента ДНК, сложные структурные варианты, которые включают повторяющиеся хромосомные перестройки в одном и том же локусе (например,г. инверсии внутри дупликации) и мультиаллельные CNVs [2]. CNV широко распределены по геному, в совокупности составляя больше изменений пар оснований между индивидуумами, чем все SNP вместе взятые [3], и каждое событие может влиять на от 1 КБ до нескольких МБ ДНК. Хотя общие CNV (например, частота> 1%) часто представляют собой доброкачественные полиморфизмы, редкие CNV в определенных локусах уже давно признаны важными факторами риска менделевских расстройств и сложных нейропсихиатрических расстройств.
Поскольку делеции 22q11.2 впервые были связаны с повышенным риском шизофрении [4], крупномасштабные генетические исследования выявили дополнительные CNV, которые способствуют развитию различных психоневрологических расстройств, таких как шизофрения, расстройство аутистического спектра (РАС), умственная отсталость. (ID) / задержка развития (DD), большое депрессивное расстройство (MDD), синдром дефицита внимания и гиперактивности (ADHD), синдром Туретта (TS) и обсессивно-компульсивное расстройство (OCD) (). Более того, становится все более очевидным, что один и тот же CNV может увеличивать риск различных заболеваний (т.е. они плейотропны) и что люди без диагностированного психического расстройства часто несут риск CNVs (т.е. их пенетрантность неполная). Однако, несмотря на эти достижения, понимание биологии заболевания на основе ассоциаций CNV было сложной задачей, так как CNV большинства риска являются большими и нарушают работу нескольких генов, а причинный ген (ы), лежащий в основе каждого CNV, обычно неизвестен. Тем не менее, животные и клеточные модели, основанные на нейропсихиатрических CNV, а также анализ набора генов CNV, предоставили важную информацию о механизмах заболевания, лежащих в основе нейропсихиатрических расстройств.
Таблица 1
Исследования вариантов числа копий при нервно-психических расстройствах. Крупнейшие исследования случай-контроль и / или семейные исследования, в которых анализировались CNV, представлены для различных психоневрологических расстройств. Представлено количество конкретных CNV, задействованных в этих исследованиях. SCZ = шизофрения, ASD = расстройство аутистического спектра, ID = умственная отсталость, DD = задержка развития, MDD = большое депрессивное расстройство, ADHD = синдром дефицита внимания с гиперактивностью, TS = синдром Туретта, OCD = обсессивно-компульсивное расстройство, BD = биполярное расстройство
Фенотип | Случаи | Контроли | Трио / квадраты | N вовлеченные CNV | Ключевые ссылки | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SCZ | 21 094 2632 632 902 902 902 902 9033 9033 902 902 902 9033 902 , 6, 7] | ||||||||||
BD | 9129 | 63068 | 1 | [8] | |||||||
ADHD | 8883 | 180776 | • , 10] | ||||||||
ASD | 4315 | 70 739 | 5574 | 15 | [11, 12, 13] | ||||||
MDD | 23 97 9 | 383 095 | 3 | [14 •] | |||||||
OCD | 1613 | 1789 | 174 | 1 | [15,16] | 4093 | 2 | [17] | |||
ID / DD | 29 085 | 19584 | 70 | [18] |
В этом обзоре CNVs, которые способствуют развитию нервно-психических расстройств.Мы опишем этиологическое совпадение между различными психическими расстройствами и расстройствами нервного развития, а также недавние результаты исследований, в которых изучались эффекты нейропсихиатрических CNV в больших популяционных когортах. Наконец, мы рассмотрим, что эти открытия говорят о биологических основах психоневрологических расстройств.
Нейропсихиатрические локусы CNV
Большой объем доказательств показал, что редкие CNV вносят вклад в предрасположенность к большинству нервно-психических расстройств, при этом наибольшее количество конкретных CNV в настоящее время задействовано в исследованиях ID / DD, РАС и шизофрении ().В DD исследования случай-контроль обнаружили доказательства наличия до 70 ассоциированных CNV [18], большинство из которых являются известными причинами геномных нарушений и возникают в областях ДНК, склонных к перестройке посредством неаллельной гомологичной рекомбинации [19]. В ASD вовлечены 15 CNV в 10 локусах [11, 12, 13], тогда как для шизофрении были обнаружены убедительные статистические данные для 12 CNV риска [5, 6, 20]. Анализ бремени CNV предполагает, что дополнительные локусы риска для шизофрении будут обнаружены, когда станут доступны более крупные выборки [5], но их частота, вероятно, будет ниже, чем наблюдаемая для вовлеченных в настоящее время CNVs.Частоты и статистика ассоциации для выбранных нейропсихиатрических CNV и расстройств, взятые из опубликованных исследований случай-контроль, представлены в дополнительной таблице S1.
Позже роль редких CNV в предрасположенности к СДВГ была подтверждена на большой выборке случай-контроль из Исландии и Норвегии, где в случаях было обнаружено избыточное бремя 19 известных нейропсихиатрических CNV (отношение шансов (OR) (95% ДИ) ) = 2,43 (2,05, 2,87)), а также значимая ассоциация для 8 конкретных локусов (дополнительная таблица S1) [9 •].Частота de novo CNV при СДВГ также, по-видимому, выше, чем наблюдаемая в контроле [10], с аналогичными наблюдениями, ранее сделанными для de novo CNV в исследованиях шизофрении [7,21] и ASD [13].
Было также показано, что редкие патогенные CNV повышают склонность к более распространенным расстройствам психического здоровья, таким как MDD. Здесь короткие делеции (<100 т.п.н.) и известные нейропсихиатрические CNV обогащены у людей с депрессией [14, 22], и значительная связь была обнаружена для 3 конкретных CNV (1q21.1, дупликация PWS / AS и дупликация 16p11.2) (дополнительная таблица S1) [14 •].
Вклад CNV в ответственность BD менее очевиден; в ранних сообщениях упоминались дупликации 1q21.1, делеции 3q29 и дупликации 16p11.2, но не было обнаружено значительных различий для общегеномной скорости CNVs при BD по сравнению с контролем [8]. Хотя текущие статистические данные о конкретных рисках CNV при BD являются слабыми, некоторые CNV имеют размеры эффекта, аналогичные тем, которые наблюдаются при MDD (дополнительная таблица S1), что позволяет предположить, что более крупные выборки могут выявить устойчивые ассоциации.Однако отсутствие надежных ассоциаций CNV при BD также может частично быть связано с менее серьезными нарушениями когнитивной функции, которые обнаруживаются у пациентов с BD по сравнению с другими психическими расстройствами, такими как шизофрения [23,24], учитывая нейропсихиатрические CNVs были связаны со снижением когнитивной функции в общей популяции [25]. В поддержку этой гипотезы недавнее исследование оценивало CNV для разных субфенотипов BD и обнаружило значительное обогащение CNV только в случаях шизоаффективного биполярного расстройства (SAB) по сравнению с контролем [26 •], а у пациентов с диагнозом SAB когнитивные нарушения выше, чем у пациентов. с диагнозом ББ типа I или II [23].Исследования общих аллелей в BD также обнаружили доказательства генетической гетерогенности субфенотипов BD, где значительное повышение PRS шизофрении обнаружено у SAB по сравнению с другими субфенотипами BD [27,28]. Эти данные подчеркивают важность рассмотрения различных генетических архитектур психиатрических субфенотипов при изучении ассоциаций CNV.
Текущие исследования CNV для TS и OCD меньше, чем те, которые проводились для DD, ASD и шизофрении, хотя CNV также, как было показано, увеличивают риск этих расстройств [15, 16, 17, 29], с делециями NRXN1 и дупликации CNTN6, в настоящее время участвуют в TS [17] и 16p13.11 делеций при ОКР [15]. При тестировании в группе частота нейропсихиатрических CNV выше при TS / OCD по сравнению с контролем [15,17], что снова предполагает, что дополнительные специфические нейропсихиатрические CNV будут связаны с TS / OCD при оценке в более крупных выборках.
Общие и уникальные эффекты нейропсихиатрических CNV
По мере роста числа установленных локусов CNV для психических расстройств и нарушений развития нервной системы становится все более очевидным, что большинство нейропсихиатрических CNV сопряжены с риском множественных расстройств (дополнительная таблица S1 и).Все известные CNV риска шизофрении вовлечены в ID [6], и большинство CNVs, вовлеченных в ASD, перекрывают те, которые обнаруживаются при шизофрении [30]. Тем не менее, пенетрантность нейропсихиатрических CNV различается в зависимости от различных расстройств, и у носителей с большей вероятностью будут развиваться ранние нарушения психического развития, такие как ID / DD и ASD [31].
Отношения шансов для выбранных нейропсихиатрических CNV при различных расстройствах. Чтобы дать возможность значимого сравнения отношений шансов для различных расстройств, частота CNV для каждого расстройства сравнивалась с контрольной частотой, описанной в Kendall et al., имеющий наибольшее количество элементов управления [14 •] (дополнительная таблица S1).
Эти общие CNV указывают на плейотропные эффекты, что предполагает, что различные психоневрологические расстройства имеют перекрывающуюся биологию болезни; однако для мультигенных CNV еще не известно, связаны ли одни и те же гены с различными расстройствами [32], хотя наиболее экономным объяснением является то, что любой ген, экспрессируемый мозгом в CNV, будет иметь некоторый эффект на все психоневрологические расстройства. Крупномасштабные усилия по секвенированию могут позволить идентифицировать причинный ген (ы) для мультигенных CNV, поскольку гены, связанные с редкими вариантами кодирования при нарушениях нервного развития, обогащены в нейропсихиатрических локусах CNV [33].Единственный единственный ген CNV, который однозначно связан с множественными психоневрологическими расстройствами, включает единовременные делеции экзонов NRXN1 , что указывает на истинный плейотропный эффект этого гена. Наиболее частым фенотипом, связанным с делециями NRXN1 в клинических образцах, является ID [34], хотя шизофрения, РАС и TS также связаны. Делеции, затрагивающие промотор или экзоны на 5′-конце NRXN1 , демонстрируют более высокую пенетрантность для ID / DD по сравнению с делециями, затрагивающими только 3′-конец [35], предполагая, что размер и расположение делеций NRXN1 могут влиять на сильно изменчивый фенотипические исходы.
Накапливающиеся данные указывают на то, что дополнительная генетическая изменчивость модулирует фенотип, выраженный у носителей специфических нейропсихиатрических CNV. Например, люди с нейропсихиатрической CNV и шизофренией имеют повышенное бремя общих аллелей риска шизофрении по сравнению с контрольной группой [36,37]. Более того, у лиц с делецией 22q11.2 более высокие баллы полигенного риска шизофрении и повышенное бремя редких вариантов потери функции в синаптических генах обнаруживаются у носителей, страдающих психозом [38], тогда как у носителей с ID более высокий балл. бремя дополнительных редких CNVs [39].Аналогичные результаты были получены и для людей с РАС, у которых пациенты, несущие несколько нейропсихиатрических CNV или специфический нейропсихиатрический CNV в дополнение к редким вредоносным вариантам кодирования, имеют более тяжелые фенотипы развития нервной системы или сопутствующие заболевания [40 •].
Идентификация CNV, которые различают нервно-психические расстройства, является сложной задачей из-за различий в размере выборки в разных исследованиях. Тем не менее, одно четкое различие обнаружено для дупликаций 22q11.2, которые являются известными факторами риска для ID / DD / ASD, но имеют значительно меньшую частоту при шизофрении по сравнению с контрольной группой [5,30,41,42] (дополнительная таблица S1 и) .В целом, текущие данные свидетельствуют о том, что большинство, если не все нейропсихиатрические CNV, выявленные на сегодняшний день, повышают риск множественных расстройств.
Нейропсихиатрические CNV в общей популяции
Развитие больших популяционных генетических когорт, таких как Британский биобанк, позволило изучить влияние нейропсихиатрических CNV у лиц без диагностированного психоневрологического расстройства. Результаты этих исследований показали, что нейропсихиатрические CNV влияют на широкий спектр когнитивных, физических и медицинских качеств.Например, данные Британского биобанка показали, что почти все нейропсихиатрические CNV связаны со снижением когнитивных функций у людей, не затронутых психиатрическими фенотипами или фенотипами нервного развития [43]. Здесь влияние конкретных CNV на познание сильно коррелировало с их пенетрантностью для развития расстройства нервного развития (корреляция Пирсона = 0,74) [43]. Эти результаты подтверждают предыдущее исландское исследование, которое показало, что показатели когнитивных способностей у здоровых носителей CNV находятся между показателями, наблюдаемыми у пациентов с шизофренией и населения в целом [25].
Нейропсихиатрические CNV также повышают риск большого числа непсихиатрических заболеваний, таких как диабет, гипертония, сердечные, респираторные и почечные заболевания [44 •], а также физических характеристик (например, ИМТ, талия / соотношение бедер) [45]. Однако некоторые из этих ассоциаций могут быть результатом вторичных эффектов (например, ожирение, ведущее к гипертонии).
Крупные популяционные когорты позволили уточнить оценки распространенности и пенетрантности нейропсихиатрических CNV, поскольку они иногда могут преодолеть предвзятость установления, присущую исследованиям «случай-контроль».Например, недавнее исследование показало, что 31 нейропсихиатрический CNV имел показатель распространенности 0,8% в популяции, основанной на системе здравоохранения (90 595 человек), и что носители этих CNV имели повышенную частоту психоневрологических расстройств (включая общие состояния, такие как депрессия). и беспокойство) и врожденные пороки развития (наиболее частыми из которых были пороки сердца) [46]. Только 5,8% лиц, у которых был нейропсихиатрический CNV, имели задокументированный генетический диагноз, который поддерживает включение психоневрологических расстройств в будущие программы геномного скрининга [46].
Биологические открытия
Одной из основных целей исследований в области психиатрической генетики является углубление нашего понимания механизмов заболевания и создание новых и более эффективных методов лечения. Действительно, ранние испытания, которые адаптировали терапию к биологическим системам, предположительно нарушенным специфическими CNV у пациентов с психотическими расстройствами, показали многообещающие улучшения клинических симптомов [47]. Однако было сложно напрямую получить биологическую информацию из крупных нейропсихиатрических CNV, поскольку несколько генов в локусе, вероятно, будут играть роль [11,40 •], и какие конкретные гены связаны, остается неизвестным.Исключение составляют CNV с одним геном, которые разрушают NRXN1 , который кодирует синаптическую молекулу нейрональной адгезии, которая важна для синаптического образования, организации и пластичности [48]. Связь между единовременными делециями NRXN1 и многочисленными психическими расстройствами (дополнительная таблица S1) действительно подразумевает общие механизмы заболевания; однако существует более 100 изоформ NRXN1 , и неоднородность в размере и локализации делеции у пациентов [35,49] может вносить вклад в вариации механизмов заболевания, связанных с этим локусом.
Анализ генов CNV выявил специфические биологические процессы, нарушенные при нервно-психических расстройствах. Например, гены, относящиеся к регулируемому активностью белку, связанному с цитоскелетом, и синаптическим комплексам N, -метил-D-аспарагиновая кислота, а также ГАМКергической и глутаматергической сигнализации и потенциал-зависимым кальциевым каналам связаны с CNV при шизофрении [5 , 7,50,51]. Небольшие de novo CNVs при РАС также вовлечены в сети генов, участвующих в регуляции хроматина или синаптических белков [13], демонстрируя конвергенцию с результатами исследований шизофрении.
Понимание патологии, лежащей в основе нейропсихиатрических расстройств, также было получено на животных моделях CNV, которые воспроизводили фенотипы, наблюдаемые при психических расстройствах, такие как нарушения когнитивных функций и социального поведения [52]. Нейрональные фенотипы, наблюдаемые в моделях CNV, включают аномальную активность допаминовых клеток для делеций 1q21.1 [53], снижение возбуждающей синаптической передачи и количество синапсов для делеций NRXN1 [54,55] и измененную синаптическую пластичность для 22q11.2 удаления [52]. Хотя разные нейропсихиатрические CNV будут напрямую влиять на разные наборы генов, транскриптомные данные с моделей с делециями 15q13.3, 22q11.2 и 1q21.1 предоставили доказательства того, что общие модули коэкспрессируемых генов не регулируются всеми тремя CNV. предполагая, что эффекты от разных CNV могут сходиться на сходных биологических процессах [56]. Кроме того, исследования с участием индуцированных человеком плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК), полученных от пациентов, несущих нейропсихиатрические CNV, указали на аномалии морфологии дендритов, уменьшение размера нейронов и снижение синаптической плотности (см.[57] для подробного обзора ИПСК и CNV).
Заключение
Было показано, что редкие CNV являются важными факторами риска шизофрении, РАС и ИН. Благодаря разработке больших наборов генетических данных для контроля случаев и популяций, недавно было показано, что CNV вносят вклад в риск СДВГ и БДР. Все известные нейропсихиатрические CNV обладают существенными плейотропными эффектами, что означает, что некоторые расстройства частично имеют перекрывающуюся этиологию. Продольные и систематические исследования конкретных нейропсихиатрических CNV позволили лучше понять весь спектр связанных фенотипов, а также их влияние на людей, у которых не развилось психическое расстройство или расстройство нервного развития.Поскольку большинство известных нейропсихиатрических CNV разрушают несколько генов, было сложно сопоставить эти генетические ассоциации с конкретными биологическими процессами. Однако большая популяционная справочная карта структурных вариантов, недавно созданная на основе данных полногеномного секвенирования, известная как gnomAD-SV, показала, что большинство структурных вариантов, переносимых людьми, слишком малы, чтобы их можно было надежно обнаружить с помощью обычных данных микрочипов [2 • •]. Таким образом, в нашем понимании вклада небольших структурных вариантов в предрасположенность к психическим расстройствам существуют серьезные пробелы.Это важный пробел в знаниях, который необходимо устранить, поскольку более мелкие структурные варианты с большей вероятностью нарушат работу отдельных генов, что может дать более четкое механистическое понимание биологии болезни. Как ранее было показано в психиатрических исследованиях CNV, основанных на данных микрочипов, для выявления надежных статистических ассоциаций потребуются чрезвычайно большие наборы данных полногеномного секвенирования. Тем не менее, набор данных gnomAD-SV долгое время будет служить важным ресурсом для облегчения открытия и интерпретации более мелких нейропсихиатрических структурных вариантов в будущих исследованиях.
Заявление о конфликте интересов
Ничего не заявлено.
Ссылки и рекомендуемая литература
Статьи, представляющие особый интерес, опубликованные в течение периода обзора, были выделены следующим образом:
Благодарности
Работа в Кардиффском университете была поддержана грантом Центра Совета медицинских исследований № MR / L010305 / 1 и грант программы № G0800509. ER поддерживается стипендией будущих лидеров UKRI (Ref MR / T018712 / 1).
Приложение А.Дополнительные данные
Ниже приведены дополнительные данные к этой статье:
Ссылки
1. Sebat J., Lakshmi B., Troge J., Alexander J., Young J., Lundin P., Månér S., Massa H. , Уокер М., Чи М. Полиморфизм числа копий в геноме человека. Наука. 2004. 305: 525–528. [PubMed] [Google Scholar] 2 ••. Коллинз Р.Л., Бранд Х., Карчевски К.Дж., Чжао X., Альфельди Дж., Франсиоли Л.С., Кера А.В., Лоутер К., Готье Л.Д., Ван Х. Справочник по структурным вариациям для медицинской и популяционной генетики.Природа. 2020; 581: 444–451. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] В этой знаменательной статье представлена первая справочная карта структурных вариантов (SV), называемых данными секвенирования полного генома с высоким охватом. В статье оценивается частота и распределение делеций, дупликаций, мультиаллельных CNV, инсерций, инверсий, транслокаций и сложных SV в различных популяциях с использованием данных от 14 891 человека. Авторы сообщают, что SV вносят 25-59% всех событий усечения белка на геном и что паттерны отбора, которые действуют против SV, подобны тем, которые наблюдаются для однонуклеотидных вариантов.SV, указанные в этой статье, находятся в свободном доступе через браузер gnomAD (https://gnomad.broadinstitute.org/). Этот ресурс в значительной степени поможет интерпретации SV, обнаруженных в будущих исследованиях полногеномного секвенирования нейропсихиатрических расстройств. Редон Р., Исикава С., Фитч К.Р., Феук Л., Перри Г.Х., Эндрюс Т.Д., Фиглер Х., Шаперо М.Х., Карсон А.Р., Чен В. Глобальные вариации числа копий в геноме человека. Природа. 2006; 444: 444–454. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 4.Мерфи К.С., Джонс Л.А., Оуэн М.Дж. Высокие показатели шизофрении у взрослых с велокардио-лицевым синдромом. Arch Gen Psychiatry. 1999; 56: 940–945. [PubMed] [Google Scholar] 5. Marshall CR, Howrigan DP, Merico D., Thiruvahindrapuram B., Wu W., Greer DS, Antaki D., Shetty A., Holmans PA, Pinto D. Вклад вариантов числа копий в шизофрению из полногеномного исследования 41 321 человека. предметы. Нат Жене. 2017; 49: 27–32135. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 6. Рис Э., Кендалл К., Пардиняс А.Ф., Легге С.Е., Поклингтон А., Эскотт-Прайс В., МакКейб Дж. Х., Коллиер Д. А., Холманс П., О’Донован М.С. Анализ вариантов количества копий умственной отсталости для ассоциации с шизофренией. JAMA Psychiatry. 2016; 73: 963–969. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 7. Киров Г., Поклингтон А.Дж., Холманс П., Иванов Д., Икеда М., Рудерфер Д., Моран Дж., Чемберт К., Тончева Д., Георгиева Л. Анализ De novo CNV указывает на специфические аномалии постсинаптических сигнальных комплексов в патогенез шизофрении.Мол Психиатрия. 2012; 17: 142–153. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 8. Грин Э. К., Рис Э., Уолтерс Дж. Т. Р., Смит К. Г., Сорок Л., Грозева Д., Моран Дж. Л., Склар П., Рипке С., Чембер К. Изменение числа копий при биполярном расстройстве. Мол Психиатрия. 2016; 21: 89–93. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 9 •. Гудмундссон О.О., Уолтерс Г.Б., Ингасон А., Йоханссон С., Заяц Т., Атанасиу Л., Сондерби И.Э., Густафссон О., Наваз М.С., Йонссон Г.Ф. Синдром дефицита внимания и гиперактивности имеет тот же риск, что и шизофрения и расстройство аутистического спектра.Перевод Психиатрия. 2019; 9: 258. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] Это исследование представляет собой значительный прогресс в нашем понимании вклада CNV в развитие синдрома дефицита внимания и гиперактивности. Используя генетические данные из крупных исландских и норвежских выборок населения (всего 8883 случая и 383 095 контрольных), сообщается о избыточном бремени 19 нейропсихиатрических CNV в случаях и значительной связи для 8 конкретных CNV. Таким образом, эта статья расширяет плейотропные эффекты известных нейропсихиатрических CNV, включая СДВГ.10. Мартин Дж., Хоскинг Г., Уодон М., Ага С.С., Лэнгли К., Рис Э., Оуэн М.Дж., О’Донован М., Киров Г., Тапар А. Краткий отчет: варианты количества копий de novo у детей с синдромом дефицита внимания и гиперактивности. Перевод Психиатрия. 2020; 10: 135. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 13. Сандерс С.Дж., Хе Х., Уилси А.Дж., Эркан-Сенсичек А.Г., Самоча К.Э., Чичек А.Э., Мурта М.Т., Бал В.Х., Бишоп С.Л., Донг С. Понимание геномной архитектуры и биологии расстройства аутистического спектра по 71 локусу риска.Нейрон. 2015; 87: 1215–1233. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 14 •. Kendall KM, Rees E., Bracher-Smith M., Legge S., Riglin L., Zammit S., O’Donovan MC, Owen MJ, Jones I., Kirov G. Связь вариантов редкого числа копий с риском депрессии . JAMA Psychiatry. 2019; 76: 818–825. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] В этой статье использовались данные британского биобанка (488 366 участников) для оценки роли CNV в депрессии. Авторы обнаружили, что 53 нейропсихиатрических CNV в совокупности связаны с самооценкой депрессии.Более того, восемь отдельных нейропсихиатрических CNV были номинально значимо связаны с депрессией, а три CNV (дупликация 1q21.1, дупликация синдрома Прадера-Вилли и дупликация 16p11.2) были надежно связаны. Результаты этой работы предоставляют самые убедительные на сегодняшний день доказательства того, что CNV являются важными факторами риска депрессии и что депрессия имеет общую этиологию с другими психоневрологическими расстройствами, такими как шизофрения и умственная отсталость. МакГрат Л.М., Ю.Д., Marshall C., Davis L.K., Thiruvahindrapuram B., Li B., Cappi C., Gerber G., Wolf A., Schroeder F.A. Вариация числа копий при обсессивно-компульсивном расстройстве и синдроме Туретта: исследование перекрестных расстройств. J Am Acad Детская подростковая психиатрия. 2014; 53: 910–919. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 16. Gazzellone MJ, Zarrei M., Burton CL, Walker S., Uddin M., Shaheen SM, Coste J., Rajendram R., Schachter RJ, Colasanto M. Выявление генов риска обсессивно-компульсивного расстройства в педиатрической когорте с помощью высокого разрешения анализ вариации количества копий.J Neurodev Disord. 2016; 8: 36. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 17. Хуанг А.Ю., Ю. Д., Дэвис Л. К., Сул Дж. Х., Цецос Ф., Раменский В., Селайя И., Рамос Е. М., Осецки Л., Чен Дж. А. Редкие варианты числа копий в NRXN1 и CNTN6 увеличивают риск синдрома Туретта. Нейрон. 2017; 94: 1101–1111.e7. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 18. Coe B.P., Witherspoon K., Rosenfeld J.A., van Bon B.W.M., Vulto-van Silfhout A.T., Bosco P., Friend K.L., Baker C., Buono S., Vissers L.E.L.M. Уточняющий анализ вариации числа копий позволяет выявить конкретные гены, связанные с задержкой развития.Нат Жене. 2014; 46: 1063–1071. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 19. Лупски Дж.Р. Геномные расстройства: структурные особенности генома могут привести к перестройке ДНК и появлению признаков болезней человека. Тенденции Genet. 1998. 14: 417–422. [PubMed] [Google Scholar] 20. Рис Э., Уолтерс Дж. Br J Psychiatry. 2014; 204: 108–114.[Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 21. Кусима И., Алексич Б., Накаточи М., Шимамура Т., Шиино Т., Йошими А., Кимура Х., Такасаки Ю., Ван К., Син Дж. Анализ вариаций числа копий при шизофрении в Японии с высоким разрешением . Мол Психиатрия. 2017; 22: 430–440. [PubMed] [Google Scholar] 22. Zhang X., Abdellaoui A., Rucker J., de Jong S., Potash JB, Weissman MM, Shi J., Knowles JA, Pato C., Pato M. Общегеномное бремя редких коротких делеций обогащено большими депрессивными расстройство в четырех когортах.Биол Психиатрия. 2019; 85: 1065–1073. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 23. Линхэм А.Дж., Хаббард Л., Тэнси К.Э., Хамшер М.Л., Легге С.Э., Оуэн М.Дж., Джонс И.Р., Уолтерс Дж.Т.Р. Изучение познания в диагностическом спектре биполярного расстройства / шизофрении. J Psychiatry Neurosci. 2018; 43: 245–253. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 24. Тротта А., Мюррей Р.М., МакКейб Дж. Х. Различаются ли преморбидные и пост-начальные когнитивные функции при шизофрении и биполярном расстройстве? Систематический обзор и метаанализ.Psychol Med. 2015; 45: 381–394. [PubMed] [Google Scholar] 25. Стефанссон Х., Мейер-Линденберг А., Стейнберг С., Магнусдоттир Б., Морген К., Арнарсдоттир С., Бьорнсдоттир Г., Уолтерс Г. Б., Йонсдоттир Г. А., Дойл О. М. CNV, представляющие риск аутизма или шизофрении, влияют на когнитивные функции в контрольной группе. Природа. 2014; 505: 361–366. [PubMed] [Google Scholar] 26 •. Чарни А.В., Шталь Е.А., Грин Е.К., Чен С.-Й., Моран Дж. Л., Чембер К., Белливо Р. А., Сорти Л., Гордон-Смит К., Ли П. Х. Вклад редких вариантов числа копий в риск биполярного расстройства ограничен шизоаффективными случаями.Биол Психиатрия. 2019; 86: 110–119. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] Из-за публикации этой статьи роль CNV в биполярном расстройстве не была ясна, так как только один локус был задействован. Здесь авторы исследовали, играют ли CNV более значительную роль в предрасположенности к субфенотипам биполярных расстройств (например, биполярного расстройства I, биполярного расстройства II и шизоаффективного расстройства биполярного типа). Исследование показало, что по сравнению с контрольной группой только пациенты с диагнозом биполярного типа шизоаффективного расстройства были обогащены ХНВ.Это открытие предполагает, что в гетерогенных психических расстройствах могут существовать разные генетические структуры. Allardyce J., Leonenko G., Hamshere M., Pardiñas AF, Forty L., Knott S., Gordon-Smith K., Porteous DJ, Haywood C., Di Florio A. Связь между полигенной предрасположенностью, связанной с шизофренией, и возникновением и уровень несовместимых с настроением психотических симптомов при биполярном расстройстве. JAMA Psychiatry. 2018; 75: 28–35. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 28. Чарни А.В., Рудерфер Д.М., Шталь Э.А., Моран Дж. Л., Чембер К., Белливо Р. А., Сорти Л., Гордон-Смит К., Ди Флорио А., Ли П. Х. Доказательства генетической гетерогенности между клиническими подтипами биполярного расстройства. Перевод Психиатрия. 2017; 7 e993 – e993. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 29. Zarrei M., Burton C.L., Engchuan W., Young E.J., Higginbotham E.J., MacDonald J.R., Trost B., Chan A.J.S., Walker S., Lamoureux S. Большой ресурс данных об изменении числа копий генома при нарушениях нервного развития. NPJ Genomic Med.2019; 4: 26. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 30. Кусима И., Алексич Б., Накаточи М., Шимамура Т., Окада Т., Уно Ю., Морикава М., Исидзука К., Шиино Т., Кимура Х. Сравнительный анализ вариации числа копий при расстройстве аутистического спектра а шизофрения выявляет этиологическое совпадение и биологическое понимание. Cell Rep.2018; 24: 2838–2856. [PubMed] [Google Scholar] 31. Киров Г., Рис Э., Уолтерс Т.Дж., Эскотт-Прайс В., Георгиева Л., Ричардс А.Л., Чембер К.Д., Дэвис Г., Легге С.Э., Моран Дж.L. Пенетрантность вариаций числа копий при шизофрении и задержке развития. Биол Психиатрия. 2014; 75: 378–385. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 32. О’Донован М.С., Оуэн М.Дж. Значение общей генетики психических расстройств. Nat Med. 2016; 22: 1214–1219. [PubMed] [Google Scholar] 33. Coe B.P., Stessman H.A.F., Sulovari A., Geisheker M.R., Bakken T.E., Lake A.M., Dougherty J.D., Lein E.S., Hormozdiari F., Bernier R.A. Гены заболеваний нервной системы, связанные с мутациями de novo и изменчивостью числа копий.Нат Жене. 2019; 51: 106–116. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 34. Castronovo P., Baccarin M., Ricciardello A., Picinelli C., Tomaiuolo P., Cucinotta F., Frittoli M., Lintas C., Sacco R., Persico A.M. Фенотипический спектр моно- и биаллельной недостаточности NRXN1: систематический обзор. Clin Genet. 2020; 97: 125–137. [PubMed] [Google Scholar] 35. Lowther C., Speevak M., Armor CM, Goh ES, Graham GE, Li C., Zeesman S., Nowaczyk MJM, Schultz L.-A., Morra A. Молекулярная характеристика делеций NRXN1 из 19 263 клинических случаев с микрочипами позволяет идентифицировать экзоны важен для проявления заболеваний нервной системы.Genet Med Off J Am Coll Med Genet. 2017; 19: 53–26361. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 36. Танси К.Э., Риз Э., Линден Д.Е., Рипке С., Чамберт К.Д., Моран Дж. Л., МакКэрролл С.А., Холманс П., Киров Г., Уолтерс Дж. Общие аллели способствуют развитию шизофрении у носителей CNV. Мол Психиатрия. 2016; 21: 1085–1089. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 37. Берген С.Е., Плонер А., Хоуриган Д., О’Донован М.С., Смоллер Дж. У., Салливан П. Ф., Себат Дж., Нил Б., Кендлер К. С. Совместное влияние редких вариантов числа копий и общих SNP на риск шизофрении.Am J Psychiatry. 2019; 176: 29–35. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 38. Cleynen I., Engchuan W., Hestand M.S., Heung T., Holleman A.M., Johnston H.R., Monfeuga T., McDonald-McGinn D.M., Gur R.E., Morrow B.E. Генетические факторы риска шизофрении при наличии делеции 22q.2. Мол Психиатрия. 2020 DOI: 10.1038 / s41380-020-0654-3. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 39. Дженсен М., Кой Р.Ф., Саймон Т.Дж., Рейнерс Э., Гирираджан С., Тассон Ф. Более высокая редкая нагрузка CNV в генетическом фоне потенциально способствует фенотипам умственной отсталости у 22q.2 делеционный синдром. Eur J Med Genet. 2018; 61: 209–212. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 40 •. Пиццо Л., Дженсен М., Поляк А., Розенфельд Дж., Манник К., Кришнан А., Маккриди Э., Пишон О., Ле Кайнек К., Ван Дейк А. Редкие варианты генетического фона влияют на когнитивные функции и развитие фенотипы у лиц, несущих варианты, связанные с заболеванием. Genet Med Off J Am Coll Med Genet. 2019; 21: 816–825. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] Результаты и фенотипы, связанные с нейропсихиатрическими CNV, чрезвычайно разнообразны; однако факторы, влияющие на эту изменчивость, относительно неизвестны.В этой статье изучалось влияние дополнительных редких генетических вариантов на фенотипы, наблюдаемые у людей, несущих нейропсихиатрические CNV. Авторы обнаружили, что пробанды аутизма с множественными патогенными CNV или патогенными CNV и дополнительными редкими вариантами, нарушающими гены при сильном селективном ограничении, с большей вероятностью будут иметь более серьезные клинические признаки и нарушение когнитивных функций. Более глубокое понимание генетических факторов, которые влияют на фенотип, выраженный у носителей нейропсихиатрических CNV, позволит более точную генетическую диагностику.41. Рис Э., Киров Г., Сандерс А., Уолтерс Дж. Т. Р., Чембер К. Д., Ши Дж., Саткевич Дж., О’Душлейн К., Ричардс А. Доказательства того, что дупликации 22q.2 защищают от шизофрении. Мол Психиатрия. 2014; 19: 37–40. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 42. Li Z., Chen J., Xu Y., Yi Q., Ji W., Wang P., Shen J., Song Z., Wang M., Yang P. Полногеномный анализ роли вариации числа копий в риске шизофрении по-китайски. Биол Психиатрия. 2016; 80: 331–337. [PubMed] [Google Scholar] 43.Кендалл К.М., Бракер-Смит М., Фицпатрик Х., Линхэм А., Рис Э., Эскотт-Прайс В., Оуэн М.Дж., О’Донован М.К., Уолтерс Дж.Т.Р., Киров Г. Когнитивные характеристики и функциональные результаты носителей патогенных микроорганизмов. Варианты количества копий: анализ Биобанка Великобритании. Br J Psychiatry J Ment Sci. 2019; 214: 297–304. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 44 •. Кроуфорд К., Брэкер-Смит М., Оуэн Д., Кендалл К.М., Рис Э., Пардиняс А.Ф., Эйнон М., Эскотт-Прайс В., Уолтерс Дж.Т.Р., О’Донован М.С. Медицинские последствия патогенных CNVs у взрослых: анализ Биобанка Великобритании.J Med Genet. 2019; 56: 131–138. [PubMed] [Google Scholar] В этой статье используются данные британского биобанка, чтобы дать всестороннюю оценку медицинских последствий, связанных с нейропсихиатрическими CNV, у людей, у которых нет известных нарушений психического развития. В исследовании сообщается об известных и новых ассоциациях между нейропсихиатрическими CNV и ненейропсихиатрическими фенотипами, такими как диабет, гипертония, ожирение и почечная недостаточность. Эти результаты подтверждают необходимость дополнительного мониторинга широкого спектра заболеваний у носителей нейропсихиатрических CNV.45. Owen D., Bracher-Smith M., Kendall KM, Rees E., Einon M., Escott-Price V., Owen MJ, O’Donovan MC, Kirov G. Влияние патогенных CNV на физические характеристики участников Биобанк Великобритании. BMC Genomics. 2018; 19 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 46 ••. Мартин К.Л., Уэйн К.Э., Этьенс М.Т., Толвински К., Пален Э., Харе-Харрис А., Хабеггер Л., Максвелл Е.К., Рид Дж. Г., Уолш Л.К. Идентификация вариантов нейропсихиатрического числа копий в популяции системы здравоохранения. JAMA Psychiatry.2020; 77: 1276–1285. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] После открытия нейропсихиатрических CNV, важно оценить их влияние на больших популяционных когортах, чтобы понять их влияние в условиях здравоохранения. Путем анализа CNV и электронных медицинских записей 90 595 человек это исследование показало, что 31 нейропсихиатрический CNV имел распространенность 0,8% в популяции здравоохранения США, и что 70% людей, которые носили CNV, имели по крайней мере один клинический симптом.Интересно, что только 5,8% носителей CNV получили генетический диагноз, что свидетельствует в пользу включения нейропсихиатрических CNV и нейропсихиатрических расстройств в будущие программы геномного скрининга. Бодкин Дж. А., Коулман М. Дж., Годфри Л. Дж., Карвалью К. М. Б., Морган К. Дж., Сукков Р. Ф., Андерсон Т., Онгюр Д., Кауфман М. Дж., Левандовски К. Э. Целенаправленное лечение людей с психозами, несущих вариант с числом копий, содержащий геномное трипликацию гена глициндекарбоксилазы. Биол Психиатрия.2019; 86: 523–535. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 48. Ху З., Сяо X., Чжан З., Ли М. Генетические открытия и нейробиологические последствия использования NRXN1 при нейропсихиатрических расстройствах. Мол Психиатрия. 2019; 24: 1400–1414. [PubMed] [Google Scholar] 49. Flaherty E., Zhu S., Barretto N., Cheng E., Deans M.P., Fernando M., Schrode N., Francoeur N., Antoine A., Alganem K. Нейрональное воздействие специфического для пациента аберрантного сплайсинга NRXN1α. Нат Жене. 2019; 51: 1679–1690. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 50.Поклингтон А.Д., Рис Э., Уолтерс Дж. Нейрон. 2015; 86: 1203–1214. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 51. Szatkiewicz J.P., Fromer M., Nonneman R.J., Ancalade N., Johnson J.S., Stahl E.A., Rees E., Bergen S.E., Hultman C.M., Киров Г. Характеристика вариантов числа копий одного гена при шизофрении.Биол Психиатрия. 2020; 87: 736–744. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 52. Форсингдал А., Йоргенсен Т.Н., Олсен Л., Верге Т., Дидриксен М., Нильсен Дж. Могут ли животные модели вариантов числа копий, которые предрасполагают к шизофрении, пролить свет на основную биологию? Биол Психиатрия. 2019; 85: 13–24. [PubMed] [Google Scholar] 53. Нильсен Дж., Фейгин К., Сотти Ф., Нильсен В., Мёрк А., Кристофферсен К. Т., Явич Л., Лауридсен Дж. Б., Клаузен Д., Ларсен П. Х. Мышиная модель ассоциированного с шизофренией 1q21.Синдром микроделеции 1 демонстрирует измененную мезолимбическую передачу дофамина. Перевод Психиатрия. 2017; 7: 1–12. [Google Scholar] 54. Этертон М.Р., Блейсс К.А., Пауэлл К.М., Зюдхоф Т.С. Делеция нейрексина-1α мыши вызывает коррелированные электрофизиологические и поведенческие изменения, соответствующие когнитивным нарушениям. Proc Natl Acad Sci U S. A. 2009; 106: 17998–18003. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 55. Zeng X., Sun M., Liu L., Chen F., Wei L., Xie W. Neurexin-1 необходим для образования синапсов и ассоциативного обучения личинок у Drosophila.FEBS Lett. 2007. 581: 2509–2516. [PubMed] [Google Scholar] 56. Гордон А., Форсингдал А., Клеве И.В., Нильсен Дж., Дидриксен М., Верге Т., Гешвинд Д.Х. Транскриптомные сети подразумевают энергетические аномалии нейронов в трех моделях мышей, несущих аутизм и мутации, связанные с шизофренией. Мол Психиатрия. DOI 2019: 10.1038 / s41380-019-0576-0. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 57. Дракулич Д., Джурович С., Сайед Ю.А., Траттаро С., Капорале Н., Фальк А., Офир Р., Хайне В.М., Чавнер С.Дж.Р.А., Родригес-Морено А.Варианты числа копий (CNV): мощный инструмент для моделирования ASD на основе iPSC. Молочный аутизм. 2020; 11:42. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]tc moskova büyükelçi̇li̇ği̇ ti̇caret müşavi̇rli̇ği̇
FİRMA ADI ADRES E-MAIL WEB ADRES FİRMA YETKİLİSİ YETKİLİ TELEFONU TELEFON FAKS Поречский консервный завод Вятские Поляны районный кооператив Интеракти магазин №45 Овоши-фрукты, магазин Красногорское, д. 3, магазин Красногорское, д. 3. Ростовский р-н, Ярославская область, РФ, 152128 ул.Советская, 82, Вятские Поляни, Кировская область, РФ, 612960 ул. Комсомольская, 12, Киров, РФ, 610001 ул. Октябрьская, 2-а, Костино, Киров, РФ, 610913 ул. Баумана, 6-а, Киров, РФ , 610030 ул. Ломоносова, 35, Киров, РФ, 610033 poreche777 @ ramble r.ru ТЦ Московская обл BÜYÜKELÇİLİĞİ TİCARET MÜŞAVİRLİĞİ е-Posta: [email protected] www.musavirlikler.gov.tr Руся FEDERASYONU yas_meyve_sebze TİCARETİ Ile İLGİLİ FİRMALAR önemli НЕ: FİRMALARIN TARAFINIZDAN KONULARINA Gore SEÇİLMESİNDE VE YAZIŞMALARINIZIN Руска YAPILMASINDA BÜYÜK FAYDA B Бабикян Вардана Grachikovich Мельников Александр Иванович Владимиров Alexandr Васильевич Суворова Елена Владимировна Гузаиров Руслан Ринатович Тел./ Факс: (83334) 6-26-57 +7 (48536) 2-02-39 +7 (48536) 2-02-67 +7 (83334) 6-09-98 +7 (83334) 6-26- 57 +7 (8332) 37-29-01 +7 (8332) 50-83-81 +7 (8332) 40-03-81 +7 (8332) 53-64-08
- Стр. 2 и 3: Лидия Магазин Абастон Петробалт Компа
- Стр. 4 и 5: Шипка, торговопромышленная компания
- Стр. 6 и 7: Торгово-промышленный комплекс им. Кирова
- Стр. 8 и 9: Ягодное Красногорское племенное предприятие
- Стр. 10 и 11: Сернурское р-н КПО
- Стр. 12 и 13: Совхоз им. Ленина Вязни
- Стр. 14 и 15: Челябинский масложировой комбинат
- Стр.16 и 17: Козлова Р.У., ИП Овощной процесс
- Стр. 18 и 19: Волгоградский консервный завод Майская теплица
- Стр. 20 и 21: Шарангское РПН
- Стр. 22 и 23: Производственное предприятие «Пищевик» Она
- Стр. 24 и 25: ул. Маршала Жукова , Тепличный (mag
- Стр. 26 и 27: Иркутский областной союз потребителей Стр.
- Стр. 28 и 29: YDA BULUNMAKTADIR. ÜRÜNLER Meat a
- Стр. 30 и 31: Фрукты и овощи, консервированные в бутылках
- Стр. 32 и 33: Сеть магазинов и супермаркетов Мясо
- Стр. 34 и 35: Специи и зелень (торговля) Свежие фрукты
- Стр. 36 и 37: Фрукты и овощи, консервированные, в бутылках
- Стр. 38 и 39: Свежие фрукты, овощи и грибы
- Стр. 40 и 41: Фрукты и овощи, переработанные Fru
- Стр. 42 и 43: Мебель, детская Трубки, трубки,
- Стр. 44 и 45: Фрукты и овощи, переработанные Fru
- Стр. 46 и 47: Сеть магазинов и супермаркетов Молочные продукты 9 0011
- Стр. 48 и 49: Свежие фрукты, овощи и грибы
- Стр. 50 и 51: Ящики, коробки и ящики, деревянные, fo
- Стр. 52 и 53:
Фрукты и овощи, переработанные Фрукты
- Стр. 54:
Фрукты и овощи, переработанные Фрукты
показать все
Ассоциация вариантов количества редких копий с риском депрессии | Депрессивные расстройства | JAMA Psychiatry
Ключевые моментыВопрос Связаны ли редкие варианты числа копий с депрессией в большой выборке населения?
Выводы В этом исследовании случай-контроль с участием 407074 человек в исследовании UK Biobank, варианты числа копий расстройств нервного развития, по-видимому, связаны с риском депрессии у лиц без нарушений психического развития.Физическое здоровье, уровень образования, социальная депривация, статус курения и потребление алкоголя являются переменными, которые частично объясняют эту связь, и не было обнаружено никаких доказательств связи между показателями бремени вариантов числа копий и депрессией.
Значение Варианты числа копий, связанных с развитием нервной системы, по-видимому, связаны с повышением риска депрессии у людей без нарушений психического развития.
Важность Роль вариантов с большим редким числом копий (CNV) в нервно-психических расстройствах хорошо известна, но их связь с распространенными психическими расстройствами, такими как депрессия, остается неясной.
Объектив Изучить связь группы из 53 CNV, связанных с нарушениями развития нервной системы, и бремени редких CNV с риском депрессии.
Дизайн, обстановка и участники В этом исследовании случай-контроль использовались данные из выборки UK Biobank, в которую вошли 502534 человека, проживающих в Соединенном Королевстве. Исключались лица с расстройством аутистического спектра, умственной отсталостью, синдромом дефицита внимания / гиперактивности, шизофренией или биполярным аффективным расстройством.В дальнейшем анализы были ограничены людьми европейского генетического происхождения (n = 407 074). Исследование проводилось с января 2017 года по сентябрь 2018 года.
Экспозиции Статус перевозчика CNV.
Основные результаты и мероприятия Что касается первичного результата, то пациенты, которые сообщили, что врач сказал им, что у них был диагноз депрессии, были определены как случаи. Анализы были повторены с использованием двух альтернативных определений депрессии: депрессия, о которой сообщалось в течение всей жизни, с текущим назначением антидепрессантов на момент посещения 1 и диагноз депрессии при выписке из больницы.
Результаты Варианты числа копий выявлены у 488366 человек в возрасте от 37 до 73 лет. Всего в исследование были включены 407 074 человека с европейским генетическим происхождением (220201 женщина [54,1%]; средний [SD] возраст 56,9 [8,0] лет). Из этих людей 23979 (5,9%) сами сообщили о депрессии на протяжении всей жизни, а 383095 (94,1%) не сообщили о депрессии на протяжении всей жизни. Группа из 53 CNV, связанных с развитием нервной системы, была связана с самооценкой депрессии (отношение шансов [OR], 1.34; 95% ДИ, 1,19–1,49, нескорректированный P = 1,38 × 10 –7 ), и эти результаты были согласованы при использовании двух альтернативных определений депрессии. Эта связь частично объяснялась физическим здоровьем, уровнем образования, социальной депривацией, статусом курения и употреблением алкоголя. Сильная независимая связь оставалась между CNV нервного развития и депрессией в анализах, которые включали эти другие показатели (OR, 1,26; 95% CI, 1,11-1,43; P = 2.87 × 10 −4 ). Восемь индивидуальных CNV были номинально связаны с риском депрессии, и 3 из этих 8 CNV (дупликация 1q21.1, дупликация синдрома Прадера-Вилли и дупликация 16p11.2) пережили коррекцию Бонферрони для 53 протестированных CNV. После исключения носителей CNV, связанных с развитием нервной системы, не было обнаружено никакой связи между показателями нагрузки CNV и депрессией.
Выводы и значимость CNV, связанные с развитием нервной системы, по-видимому, связаны с депрессией, расширяя спектр клинических фенотипов, связанных со статусом носительства CNV.
Роль вариантов с большим редким числом копий (CNV) в нарушениях развития нервной системы, включая расстройство аутистического спектра, умственную отсталость, синдром дефицита внимания / гиперактивности и шизофрению, хорошо известна. 1 -5 При шизофрении сообщалось об ассоциациях как с отдельными CNV, так и с повышенным бременем редких делеций и дупликаций. 6 -8 Напротив, связь между CNV и риском депрессии остается неясной.Исследования CNV при депрессии были основаны на относительно небольших выборках 9 -15 и дали противоречивые результаты, а их результаты не соответствовали критериям общегеномной значимости. База данных британского биобанка теперь предлагает возможность исследовать связь между CNV и депрессией в хорошо фенотипированной выборке и в большем масштабе, чем это было возможно.
Мы сообщаем о CNV-анализе депрессии во всем образце биобанка Великобритании.Предыдущие исследования показали, что значительная часть обогащения CNV при шизофрении объясняется CNV, связанными с нарушениями развития нервной системы. 6 , 16 Депрессия разделяет генетический риск с шизофренией 17 , 18 и часто сопутствует расстройствам нервного развития. 19 , 20 В совокупности эти данные подтверждают гипотезу о том, что, если CNV играют роль в депрессии, CNV, связанные с развитием нервной системы, наиболее вероятно связаны.Мы также проверили более общую гипотезу о том, что на уровне всего генома бремя CNV связано с депрессией.
Настоящее исследование проводилось с января 2017 года по сентябрь 2018 года в соответствии с условиями проекта британского Биобанка № 14421. Этическое одобрение Британского Биобанка было предоставлено Северо-Западным многоцентровым комитетом по этике, и все участники предоставили информированное согласие на участие в нем. Проекты Биобанка Великобритании.
В период с 2006 по 2010 год в исследование UK Biobank было включено 502534 человека (54% женщин) в возрасте от 37 до 73 лет, проживающих в Соединенном Королевстве.Фенотипические данные собирались в центрах оценки с помощью сенсорных устройств и интервью под руководством медсестер. Участники предоставили образцы крови, мочи и слюны.
В исследованиях депрессии, проведенных Британским Биобанком до настоящего времени, использовалось несколько определений расстройства. 21 , 22 Ввиду отсутствия консенсуса по определению случая, мы использовали относительно либеральное определение пожизненной депрессии, оценивая как случаи тех людей, которые сообщили, что врач сказал им, что у них депрессия.Мы повторили наш анализ, используя 2 альтернативных, более консервативных определения депрессии: (1) депрессия, о которой сообщают пациенты на протяжении всей жизни, с текущим назначением антидепрессантов во время визита 1 и (2) диагноз депрессии при выписке из больницы.
Для депрессии с самооценкой и назначением антидепрессанта при посещении 1 мы построили бинарную переменную депрессии, используя код депрессии 1286, о котором сообщают пациенты, в поле 20002 UK Biobank и коды рецептов антидепрессантов в поле UK Biobank 20003.Лица включались в список заболевших (статус заболевания), если они сообщали, что врач сказал им, что у них депрессия, и что они получили рецепт на лечение антидепрессантом во время первой оценки. Лица, которые соответствовали только 1 из 2 критериев (например, депрессия или только назначение антидепрессантов), были исключены из анализа.
Для диагностики депрессии при выписке из больницы мы включили лиц, страдающих от депрессии, если у них была госпитализация с первичной или вторичной Международная статистическая классификация болезней и проблем, связанных со здоровьем, десятая редакция (МКБ-10) , код депрессии (UK Biobank) поля 41202 и 41204) (рисунок 1).Для лиц, прошедших оценку в шотландских центрах оценки, были включены записи из больниц общего профиля, но не из психиатрических больниц (для центров оценки в Уэльсе и Англии записи включали как больницы общего профиля, так и психиатрические больницы). Для этих людей мы приняли вторичный код ICD-10 для депрессии в качестве доказательства диагноза депрессии, поскольку он мог быть закодирован при поступлении в больницу общего профиля. Однако из-за отсутствия первичных кодов ICD-10 для депрессии мы не смогли определить отсутствие депрессии в контрольной группе (тех, кто не пострадал).Поэтому мы удалили шотландские элементы управления из этой переменной.
В 2017 году в общей сложности 157397 человек заполнили интерактивную анкету по вопросам психического здоровья. Мы стремились дополнительно охарактеризовать ассоциации с фенотипами депрессии у лиц, которые заявили в этой анкете, что когда-либо испытывали длительное чувство печали или депрессии (поле UK Biobank 20446). Мы исследовали данные по следующим параметрам: (1) возраст первого эпизода депрессии (поле UK Biobank 20433), (2) продолжительность наихудшей депрессии (поле UK Biobank 20438) и (3) количество эпизодов депрессии в течение жизни (UK Biobank). поле 20442).Продолжительность наихудшей депрессии кодировалась в диапазоне месяцев (например, менее месяца, от 1 месяца до 3 месяцев). Предыдущие данные показали, что средняя продолжительность депрессивного эпизода составляет 3 месяца. 23 Таким образом, эта переменная была разделена на от 0 до 3 месяцев и более 3 месяцев. Количество эпизодов депрессии в течение жизни было разделено на дихотомию с использованием метода разделения по медиане (медиана = 1).
Генотипирование и вызов CNV
ДНКбыла выделена из цельной крови 24 и затем генотипирована (в лаборатории Affymetrix Research Services) на массивах UK Biobank Axiom и UK BiLEVE.Генотипы были переданы в Кардиффский университет после подачи заявки в Биобанк Великобритании. Мы выполнили вызов CNV с помощью протоколов PennCNV-Affy 1.0.3 25 (PennCNV) с использованием двуаллельных маркеров, общих для обеих платформ генотипирования; этот процесс подробно описан в другом месте (таблица 6 в Приложении). 26 Как сообщалось в предыдущих анализах CNV нашей группы в UK Biobank, никаких эффектов партии не наблюдалось. 27 Анализ нагрузки CNV проводился на вызовах CNV, созданных PennCNV-Affy с использованием PLINK 1.07 набор инструментов для анализа (таблица 7 в Приложении). 28 Отдельные образцы исключались, если в них было 30 или более CNV, коэффициент волнистости больше 0,03 или меньше -0,03, частота выявления однонуклеотидного полиморфизма ниже 96% или коэффициент log R SD выше 0,35. Отдельные CNV исключались, если они были покрыты менее чем 20 зондами, имели плотность покрытия менее 1 зонда на 20000 пар оснований или показатель достоверности ниже 10. В таблице 9 Приложения представлены критерии для вызова индивидуальных CNV.
Определение наборов CNV и статистический анализ
Следуя подходу недавнего исследования нашей группы с использованием данных британского биобанка, 26 мы определили группу CNV, связанных с развитием нервной системы, как те 54 CNV, для которых существует, по крайней мере, номинально статистически значимое свидетельство связи с расстройствами нервного развития ( P <.05; eТаблица 11 в Приложении). 3 Мы исключили высокочастотную дупликацию 15q11.2, что привело к окончательному списку из 53 CNV, связанных с развитием нервной системы. Уровень значимости был установлен на уровне P <0,05. В исследовательском анализе мы исследовали каждый из CNV с 5 или более наблюдениями на предмет связи с депрессией, о которой сообщают сами, и результаты были подвергнуты корректировке для 53 тестов ( P пороговое значение 0,00094).
Анализ нагрузки CNV проводился с использованием PLINK в областях с переменным количеством копий при трех пороговых значениях размера: (1) 100 килобаз (кб) или больше, (2) 500 кб или больше и (3) 1 мегабаза (Мб) или больше.CNV были отфильтрованы на частоту менее 1% с помощью команды cnv-freq-exclude-above, а перекрывающиеся области повтора нижней копии были отфильтрованы с помощью команды cnv-exclude. Выходные данные PLINK были преобразованы в статус несущей CNV, который использовался в регрессионном анализе. Для всех анализов нагрузки были исключены носители группы из 53 CNV, связанных с нарушениями развития нервной системы.
Анализ ассоциацийбыл проведен в R (R Foundation for Statistical Computing) с использованием логистической или линейной регрессии, в зависимости от ситуации, и с возрастом, полом, набором генотипов и первыми 15 основными компонентами в качестве ковариат (eTable 8 в Приложении).Анализы были ограничены людьми европейского генетического происхождения (n = 407 074). Это ограничение было определено путем вычисления минимальной оценки детерминанта ковариации местоположения и разброса, а затем отбора людей в пределах 90-го процентиля минимального расстояния детерминанта ковариации (функция covMCD в робастной базе в R). 29 , 30 Мы исключили людей с расстройством аутистического спектра, умственной отсталостью, синдромом дефицита внимания / гиперактивности, шизофренией или биполярным аффективным расстройством, диагностированным врачом (поля UK Biobank 20002 и 20544) или диагностическим кодом во время пребывания в больнице. допуск (поля 41202 и 41204 UK Biobank).
Дальнейшее исследование CNV нейроразвития и ассоциации депрессии
Чтобы лучше понять связь между CNV, связанными с развитием нервной системы, и депрессией, мы исследовали, объясняется ли эта связь переменными, которые, как известно, связаны с депрессией 31 -34 и постулируются как связанные с CNV: , (2) физическое здоровье (затронутый статус для 1 из медицинских фенотипов, связанных с этими CNV), 27 (3) социальная депривация (индекс депривации Таунсенда), (4) курение (статус курения) и (5) потребление алкоголя (частота приема алкоголя).
Перед этим анализом данные из области академических квалификаций были дихотомизированы и перекодированы в диплом колледжа или университета или все другие квалификации, подход, который ранее использовался для этого поля данных (поле 6138 UK Biobank). 35 Для переменной физического здоровья мы использовали затронутый статус для медицинских фенотипов, связанных с CNV, в недавней работе нашей группы. 27 Переменная социальной депривации измерялась с использованием кодов индекса депривации Таунсенда (поле 189 UK Biobank).Курение изучалось с использованием статуса курения (поле UK Biobank, 20116), а потребление алкоголя – с использованием частоты потребления алкоголя (поле UK Biobank 1558).
Анализы проводились с использованием моделирования структурных уравнений в пакете lavaan в R, который генерирует оценки прямых и косвенных эффектов. 36 Объясненная пропорция была рассчитана путем деления косвенного эффекта на общий эффект.
Предыдущие исследования сообщили о небольшом, но значительном превышении больших (≥500-kb) редких (частота <1%) CNV у женщин. 37 Недавние данные также свидетельствуют о том, что дети женского пола, страдающие тревогой или депрессией, с большей вероятностью несут большие CNV, чем дети мужского пола. 38 Это открытие привело нас к изучению показателей депрессии у женщин и мужчин, носителей CNVs в нашей выборке. Обнаружив, что у избытка женщин-носителей депрессия, мы добавили в основную регрессионную модель термин взаимодействия, состоящий из продукта CNV, связанного с развитием нервной системы, и пола.
Мы сгенерировали вызовы CNV для 488 366 человек в возрасте от 37 до 73 лет.Всего в исследование были включены 407 074 человека с европейским генетическим происхождением (220201 женщина [54,1%]; средний [SD] возраст 56,9 [8,0] лет). Из этих людей 23 979 (5,9%) сами сообщили о депрессии на протяжении всей жизни, а 383 095 (94,1%) не сообщили о депрессии на протяжении всей жизни (Рисунок 1).
Связь между CNV и депрессией
Группа из 53 CNV нервного развития была связана с депрессией в первичном анализе (отношение шансов [OR], 1.34; 95% ДИ, 1,19–1,49, нескорректированный P = 1,38 × 10 −7 ; Таблица). Из лиц с депрессией 363 (1,5%) несли по крайней мере 1 из 53 CNV, связанных с развитием нервной системы, по сравнению с 4368 (1,1%) в контрольной группе. Анализ альтернативных фенотипов депрессии дал последовательные результаты, причем размер эффекта увеличивался при более консервативных определениях депрессии (таблица). Связь между CNV, связанными с развитием нервной системы, и депрессией, о которой сообщают пациенты, сохранилась после исключения случаев с диагнозом депрессии при выписке из больницы (OR, 1.35; 95% ДИ 1,21–1,51; нескорректированный P = 5,48 × 10 −8 ). Ограничение этих анализов подмножеством 12 CNV, связанных с шизофренией, дало аналогичные результаты. 5 , 6
После исключения носителей 53 CNV, связанных с развитием нервной системы, была обнаружена слабая связь между CNV размером 500 т.п.н. или больше и депрессией, которая не выдержала коррекции для множественного тестирования. Не было обнаружено никаких доказательств связи между CNV размером 100 т.п.н. или больше и 1 МБ или больше и депрессией (таблица).
Исследовательский анализ индивидуальных CNV нервного развития выявил, что 8 CNV номинально связаны с депрессией, о которой сообщают сами пациенты, из которых 3 (дупликация 1q21.1, дупликация синдрома Прадера-Вилли и дупликация 16p11.2) пережили коррекцию Бонферрони для 53 протестированных CNV нервного развития. ( P пороговое значение 0,00094; Рисунок 2 и eTable 1 в Приложении).
Связь между CNV и тяжестью депрессии
Мы использовали данные 157397 человек, которые заполнили онлайн-анкету для последующего наблюдения за психическим здоровьем, чтобы изучить связь между CNV и маркерами тяжести депрессии (возраст начала, количество депрессивных эпизодов и продолжительность наихудшего депрессивного эпизода).Мы ограничили эти анализы 68684 затронутыми людьми, которые сообщили о длительном чувстве печали или депрессии (57243 не затронуты), фенотип, который сам был связан со статусом носительства CNV нервной системы (OR, 1,20; 95% ДИ, 1,07-1,36; P = 0,002). Мы не обнаружили никакой связи между CNV нервного развития и маркерами тяжести депрессии, которые пережили коррекцию при множественных тестах (таблица 2 в Приложении). Анкета психического здоровья предоставляет возможные альтернативные параметры депрессии.Среди этих переменных – фенотип депрессии, построенный с использованием составного международного диагностического интервью – краткая форма, как сообщили Дэвис и др., 39 , и альтернативная переменная депрессии, о которой сообщают сами пациенты. Мы исследовали эти депрессивные фенотипы на предмет их связи с CNV, связанными с развитием нервной системы, и получили согласованные результаты по сравнению с первичными определениями депрессии, хотя размеры эффекта были несколько меньше, как можно было бы ожидать от более легких определений депрессии (таблица 10 в Приложении).
Дальнейшее исследование CNV нейроразвития и ассоциации депрессии
Чтобы лучше понять связь между CNV развития нервной системы и депрессией, мы исследовали, может ли эта связь быть объяснена показателями (1) уровня образования (квалификации), (2) физического здоровья (наличие или отсутствие соответствующего медицинского фенотипа), (3) ) социальная депривация (индекс депривации Таунсенда), (4) курение (статус курения) и (5) потребление алкоголя (частота потребления алкоголя).Эти переменные были выбраны из-за их известной связи с депрессией, 31 -34 их постулируемой или доказанной связи с CNV и их доступности в значительной части выборки британского биобанка. Связь между CNV нервного развития и депрессией частично объяснялась каждой исследованной переменной: 1,2% объяснялись уровнем образования; 2,9% – физическое здоровье; 8,1% – социальная депривация; 4,8%, курение; и 16,6%, потребление алкоголя (Рисунок 3 и eTable 3 в Приложении).Сильная независимая связь оставалась между CNV нервного развития и депрессией в анализах, которые включали эти другие показатели (OR, 1,26; 95% CI, 1,11–1,43; P = 2,87 × 10 −4 ).
Учитывая недавние доказательства увеличения частоты больших CNV у детей женского пола с тревогой или депрессией, 38 мы провели исследовательский анализ, который предоставил слабые доказательства более высокого уровня депрессии среди женщин-носителей CNV нервного развития, чем среди мужчин-носителей.Эта повышенная частота превышала исходную частоту самооценки депрессии у женщин (коэффициент взаимодействия, OR, 0,66; 95% ДИ, 0,53-0,83; нескорректированный P = 0,002; таблицы 4 и 5 в Приложении) . Однако эта связь была более слабой для определений вторичной депрессии.
Насколько нам известно, это исследование является крупнейшим на сегодняшний день исследованием CNV при депрессии. Мы провели CNV-анализ депрессии в образце британского биобанка из 407 074 человек с европейским генетическим происхождением.Основное определение депрессии – это самоотчет человека о том, что когда-либо ему был поставлен медицинский диагноз депрессии (депрессия, о которой он сам сообщил). Чтобы убедиться, что результаты не ограничиваются этим определением, мы также проверили 2 более консервативных фенотипа: (1) депрессия, о которой сообщалось в течение всей жизни, с текущим назначением антидепрессантов во время визита 1 и (2) диагноз депрессии при выписке из больницы. Мы искали ассоциацию с депрессией для группы из 53 CNV, которые, как известно, связаны с нарушениями развития нервной системы, 3 , и после исключения лиц с CNV, относящимися к первичной гипотезе, мы проверили остаточную объясненную нагрузку среди CNV размером 100 т.п.н. или больше, 500 Кб или больше и 1 Мб или больше.Результаты подтверждают нашу первую гипотезу о том, что CNV, которые ранее были связаны с нарушениями развития нервной системы, связаны с повышенным риском пожизненной депрессии, независимо от того, определяется ли это на основании самооценки диагноза, самооценки диагноза в сочетании с лечением антидепрессантами или на основании диагноза выписки из больницы. Из этого анализа были исключены пациенты с диагнозом нервно-психического развития или психоневрологическим расстройством, и, таким образом, связь вряд ли могла быть объяснена ассоциациями с этими расстройствами.
Три CNV нервного развития (дупликация 1q21.1, дупликация синдрома Прадера-Вилли и дупликация 16p11.2) были индивидуально связаны с депрессией на уровнях статистической значимости, выжившие после поправки Бонферрони для 53 протестированных CNV нервного развития. Ни один из этих локусов CNV не перекрывается с локусами риска, недавно идентифицированными в большом исследовании ассоциации генома депрессии. 18 Риск депрессии у носителей CNV в текущем исследовании (независимо от того, рассматривались ли CNV индивидуально или коллективно) был ниже по сравнению с риском, выявленным в предыдущих исследованиях шизофрении.Однако качественно результаты следовали аналогичной схеме: самый высокий риск обоих расстройств был связан с 3q29del (депрессия OR, 11,22 против шизофрении OR, 57,65), а самый низкий риск для обоих расстройств был связан с 16p12.1del (депрессия OR, 1,47 против шизофрении OR, 3.3). 5 , 6 После исключения CNV, связанных с развитием нервной системы, мы не обнаружили доказательств остаточного бремени риска депрессии среди CNV размером 100 kb или больше, 500 kb или больше и 1 Mb или больше.
Дальнейшее исследование связи между CNV нервного развития и риском депрессии показало, что эта связь частично объясняется уровнем образования, социальной депривацией, физическим здоровьем, статусом курения и потреблением алкоголя.Насколько нам известно, это первое исследование, показывающее, что эти CNV связаны с показателями социальной депривации по соседству, и, таким образом, оно подразумевает важный механизм, с помощью которого статус носителя CNV может увеличивать риск депрессии. Продольные данные по этим показателям необходимы для установления причинной направленности между депрессией и социальной депривацией.
Это исследование имеет некоторые ограничения. Первичное определение депрессии основывалось на самооценке – методе, который, как известно, подвержен искажению информации. 40 Однако маловероятно, что это определение существенно повлияло на результаты, учитывая почти идентичные или даже более сильные результаты, полученные при использовании диагноза фенотипа депрессии при выписке из больницы. Еще одним ограничением является относительно низкий уровень депрессии по сравнению с оценками населения. 41 Этот более низкий показатель, возможно, был связан с более высоким, чем в среднем, здоровьем и функционированием образца британского биобанка, а также неточным определением депрессии.Однако эти факторы вряд ли могли вызвать ложные ассоциации CNV, а вместо этого разбавили бы ассоциации со статусом носителя CNV.
CNV нервного развития обладают неполной пенетрантностью для основных нарушений развития, 42 , но за пределами их ассоциации с легкими когнитивными нарушениями, 26 , 43 мало что известно об их фенотипических ассоциациях со статусом носителя CNV. Насколько нам известно, это исследование является первым, которое убедительно демонстрирует связь между этими CNV и риском депрессии и, таким образом, расширяет спектр клинических фенотипов, связанных со статусом носительства CNV.Эта работа повторяет, что носители CNV без нарушений развития нервной системы не могут считаться здоровыми. Похоже, что наряду с проявлениями когнитивного и физического здоровья при оценке CNV на популяционном уровне необходимо учитывать более широкие последствия депрессии и социальной депривации.
Принято к публикации: 3 января 2019 г.
Опубликовано в Интернете: 17 апреля 2019 г. doi: 10.1001 / jamapsychiatry.2019.0566
Открытый доступ: Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии CC-BY. © 2019 Kendall KM et al. JAMA Psychiatry .
Автор, ответственный за переписку: Джеймс Тайнан Рис Уолтерс, доктор философии, Центр нейропсихиатрической генетики и геномики MRC, Отдел психологической медицины и клинических нейронаук, Кардиффский университет, здание Хадин Эллис, Мэйнди-роуд, Кардифф, Уэльс CF24 4HQ (waltersjt @ card. ac.uk).
Вклад авторов: Доктора Кендалл и Уолтерс имели полный доступ ко всем данным в исследовании и несли ответственность за целостность данных и точность анализа данных.
Концепция и дизайн: Кендалл, О’Донован, Оуэн, Джонс, Киров, Уолтерс.
Сбор, анализ или интерпретация данных: Кендалл, Рис, Брэкер-Смит, Легге, Риглин, Заммит, О’Донован, Джонс, Киров, Уолтерс.
Составление рукописи: Кендалл, О’Донован, Уолтерс.
Критический пересмотр рукописи на предмет важного интеллектуального содержания: Все авторы.
Статистический анализ: Кендалл, Рис, Брэкер-Смит, Легге, Киров, Уолтерс.
Получено финансирование: Кендалл, Оуэн, Джонс, Уолтерс.
Административная, техническая или материальная поддержка: О’Донован.
Наблюдение: О’Донован, Оуэн, Джонс, Киров, Уолтерс.
Раскрытие информации о конфликте интересов: Д-р Кендалл сообщил о получении грантов от Wellcome Trust и грантов от Совета по медицинским исследованиям (MRC) во время проведения исследования. Д-р Брэкер-Смит сообщил о получении грантов от MRC во время проведения исследования.Доктора О’Донован, Оуэн и Уолтерс сообщили о получении грантов от MRC во время проведения исследования и гранта MR / P005748 / 1 для молекулярно-генетических исследований шизофрении; и сообщили о получении грантов от Takeda Pharmaceuticals помимо представленных работ. О других раскрытиях информации не сообщалось.
Финансирование / поддержка: Это исследование частично финансировалось стипендиатом Wellcome Trust по обучению клиническим исследованиям (д-р Кендалл). Работа в Кардиффском университете была поддержана грантом MRC Center MR / L010305 / 1, грантом программы G0800509 и грантом проекта MR / L011794 / 1.
Роль спонсора / спонсора: Спонсоры не играли никакой роли в разработке и проведении исследования; сбор, управление, анализ и интерпретация данных; подготовка, рецензирование или утверждение рукописи; и решение представить рукопись для публикации.
3. Коэ BP, Уизерспун К. Розенфельд JA, и другие. Уточняющий анализ вариации числа копий позволяет выявить конкретные гены, связанные с задержкой развития. Нат Генет . 2014; 46 (10): 1063-1071. DOI: 10.1038 / ng.3092PubMedGoogle ScholarCrossref 10. Дегенхардт F, Прибе L, Herms S, и другие. Связь между вариантами числа копий в 16p11.2 и большим депрессивным расстройством в немецкой выборке случай-контроль. Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet . 2012; 159B (3): 263-273. DOI: 10.1002 / ajmg.b.32034PubMedGoogle ScholarCrossref 15.Тэнси KE, Ракер Джей Джей, Кавана DH, и другие. Варианты числа копий и терапевтический ответ на лечение антидепрессантами при большом депрессивном расстройстве. Фармакогеномика J . 2014; 14 (4): 395-399. DOI: 10.1038 / tpj.2013.51PubMedGoogle ScholarCrossref 16.Rees Э, Уолтерс JT, Шамбер KD, и другие; Консорциум Wellcome Trust Case Control. Анализ CNV в большом образце шизофрении выявляет делеции в 16p12.1 и SLC1A1 и дупликации в 1p36.33 и CGNL1. Хум Мол Генет . 2014; 23 (6): 1669-1676. DOI: 10.1093 / hmg / ddt540PubMedGoogle ScholarCrossref 18.Wray Н.Р., Рипке S, Mattheisen М, и другие; eQTLGen; 23andMe; Рабочая группа по серьезным депрессивным расстройствам Консорциума психиатрической геномики.Полногеномный ассоциативный анализ выявляет 44 варианта риска и уточняет генетическую архитектуру большой депрессии. Нат Генет . 2018; 50 (5): 668-681. DOI: 10.1038 / s41588-018-0090-3PubMedGoogle ScholarCrossref 22.Howard DM, Адамс MJ, Ширали М, и другие; Исследовательская группа 23andMe. Полногеномное исследование ассоциации фенотипов депрессии в UK Biobank выявляет варианты возбуждающих синаптических путей. Нац Коммуна . 2018; 9 (1): 1470. DOI: 10.1038 / s41467-018-03819-3PubMedGoogle ScholarCrossref 23.Spijker Дж, де Грааф R, Bijl RV, Beekman AT, Ормель J, Нолен WA. Продолжительность серьезных депрессивных эпизодов среди населения в целом: результаты Обследования психического здоровья в Нидерландах и исследования заболеваемости (NEMESIS). Br J Психиатрия . 2002; 181 (3): 208-213. DOI: 10.1192 / bjp.181.3.208PubMedGoogle ScholarCrossref 25.Wang К, Ли М, Хэдли D, и другие. PennCNV: интегрированная скрытая марковская модель, разработанная для обнаружения вариаций числа копий с высоким разрешением в данных полногеномного генотипирования SNP. Genome Res . 2007; 17 (11): 1665-1674. DOI: 10.1101 / gr.6861907PubMedGoogle ScholarCrossref 28.Purcell С, Нил B, Тодд-Браун K, и другие. PLINK: набор инструментов для анализа ассоциаций всего генома и популяционных связей. Ам Дж. Хам Генет . 2007; 81 (3): 559-575. DOI: 10.1086 / 519795PubMedGoogle ScholarCrossref 35.Davies G, Мариони RE, Левальд ОКРУГ КОЛУМБИЯ, и другие. Полногеномное ассоциативное исследование когнитивных функций и уровня образования в UK Biobank (N = 112151). Мол Психиатрия . 2016; 21 (6): 758-767. DOI: 10.1038 / mp.2016.45PubMedGoogle ScholarCrossref 38.Martin Джей, Таммиис К. Карлссон Р, и другие. Вариация числа копий и психоневрологические проблемы у мужчин и женщин в общей популяции. [опубликовано в Интернете 11 октября. Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet . 2018. doi: 10.1002 / ajmg.b.32685Google Scholar39.Davis КАС, Коулман JRI, Адамс М, и другие. Психическое здоровье в британском Биобанке: разработка, внедрение и результаты онлайн-анкеты, заполненной 157 366 участниками. BJPsych Открыть . 2018; 4 (3): 83-90. DOI: 10.1192 / bjo.2018.12PubMedGoogle ScholarCrossrefПроизошла ошибка при настройке вашего пользовательского файла cookie
Произошла ошибка при настройке вашего пользовательского файла cookieЭтот сайт использует файлы cookie для повышения производительности. Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.
Настройка вашего браузера для приема файлов cookie
Существует множество причин, по которым cookie не может быть установлен правильно.Ниже приведены наиболее частые причины:
- В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки своего браузера, чтобы он принимал файлы cookie, или чтобы спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
- Ваш браузер спрашивает вас, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались. Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, нажмите кнопку «Назад» и примите файлы cookie.
- Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Если вы подозреваете это, попробуйте другой браузер.
- Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г., браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы исправить это, установите правильное время и дату на своем компьютере.
- Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie. Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.
Почему этому сайту требуются файлы cookie?
Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу.Чтобы предоставить доступ без файлов cookie потребует, чтобы сайт создавал новый сеанс для каждой посещаемой страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.
Что сохраняется в файле cookie?
Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в cookie; никакая другая информация не фиксируется.
Как правило, в файлах cookie может храниться только информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта.Например, сайт не может определить ваше имя электронной почты, пока вы не введете его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступа к остальной части вашего компьютера, и только сайт, который создал файл cookie, может его прочитать.
.