Вахрушевская школа: МКОУ Вахрушевская ООШ: Главная страница

Вахрушевская основная общеобразовательная школа в Коченево, Московская, 8/3

⭐ Отзывы

Вахрушевская основная общеобразовательная школа – адрес сайта

Вахрушевская основная общеобразовательная школа в Коченево, информация о сайте s_vahrush.koch.edu54.ru.

Вахрушевская основная общеобразовательная школа по адресу 632633, Новосибирская область, Коченево, Московская, 8/3 в дальнейшем Организация, размещена в следующих категориях:

Для связи с организацией воспользуйтесь номером телефона: +7 (38351) 3-01-24. Пн: c 09:00-17:00, Вт: c 09:00-17:00, Ср: c 09:00-17:00, Чт: c 09:00-17:00, Пт: c 09:00-17:00, Сб: c 09:00-15:00, Вс: выходной, вы можете обратиться в эту организацию.

Хотим обратить ваше внимание, на то, что у Организации есть сайт http://s_vahrush.koch.edu54.ru, поэтому для актуализации контактных данных советуем его посетить.

Если хотите посетить организацию, советуем вам заранее проложить маршрут. С помощью карты ниже, вы можете узнать точное расстояние, рекомендуемый маршрут, а также загруженность дорог в Коченево.

Карта

Ориентировочное расстояние от центра города до организации 25.7 км.

Отзывы и обсуждение:

К сожалению, отзывов и комментариев нет. Поделитесь своим мнение, будьте первым =)

Как вы оцениваете организацию ?

Минимум символов: 0/50

Публикуя отзыв, Вы даёте согласие на обработку персональных данных.

Возможно вам будут интересны другие организации:

Адрес: Новосибирская область, Коченево, Чехова, 22
Режим работы: Пн: c 10:00-19:00, Вт: c 10:00-19:00, Ср: c 10:00-19:00, Чт: c 10:00-19:00, Пт: c 10:00-19:00, Сб: c 09:00-15:00, Вс: выходной

Тел.: +7 (38351) 2-61-98
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Строительная, 7Б
Режим работы: Пн: c 07:30-18:00, Вт: c 07:30-18:00, Ср: c 07:30-18:00, Чт: c 07:30-18:00, Пт: c 07:30-18:00, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел. : +7 (38351) 2-44-86
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Победы, 24/1
Режим работы: Пн: c 07:45-18:15, Вт: c 07:45-18:15, Ср: c 07:45-18:15, Чт: c 07:45-18:15, Пт: c 07:45-18:15, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел.: +7 (38351) 2-39-84
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Пушкина, 44
Режим работы: Пн: c 07:45-18:15, Вт: c 07:45-18:15, Ср: c 07:45-18:15, Чт: c 07:45-18:15, Пт: c 07:45-18:15, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел.: +7 (38351) 2-20-14
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Ипподромская, 2/4
Режим работы: Пн: c 07:15-17:45, Вт: c 07:15-17:45, Ср: c 07:15-17:45, Чт: c 07:15-17:45, Пт: c 07:15-17:45, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел.: +7 (38351) 2-60-60
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Строительная, 29
Режим работы: Пн: c 07:30-18:00, Вт: c 07:30-18:00, Ср: c 07:30-18:00, Чт: c 07:30-18:00, Пт: c 07:30-18:00, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел. : +7 (38351) 2-20-10
Адрес: Новосибирская область, Коченево, территория Военный Городок, 100/1
Режим работы: Пн: c 07:45-18:15, Вт: c 07:45-18:15, Ср: c 07:45-18:15, Чт: c 07:45-18:15, Пт: c 07:45-18:15, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел.: +7 (38351) 3-21-11
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Школьная, 6/2
Режим работы: Пн: c 08:30-17:30, Вт: c 08:30-17:30, Ср: c 08:30-17:30, Чт: c 08:30-17:30, Пт: c 08:30-17:30, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел.: +7 (38351) 3-01-80
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Школьная, 4
Режим работы: Пн: c 08:30-17:30, Вт: c 08:30-17:30, Ср: c 08:30-17:30, Чт: c 08:30-17:30, Пт: c 08:30-17:30, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел.: +7 (38351) 3-11-15
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Школьная, 13
Режим работы: Пн: c 08:00-17:00, Вт: c 08:00-17:00, Ср: c 08:00-17:00, Чт: c 08:00-17:00, Пт: c 08:00-17:00, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел. : +7 (38351) 3-91-95
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Сибирская, 50 к1
Режим работы: Пн: c 08:00-17:00, Вт: c 08:00-17:00, Ср: c 08:00-17:00, Чт: c 08:00-17:00, Пт: c 08:00-17:00, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел.: +7 (38351) 3-51-12
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Центральная, 17
Режим работы: Пн: c 08:00-17:00, Вт: c 08:00-17:00, Ср: c 08:00-17:00, Чт: c 08:00-17:00, Пт: c 08:00-17:00, Сб: выходной, Вс: выходной

Тел.: +7 (38351) 3-61-28
Адрес: Новосибирская область, Коченево, Маяковского, 8
Режим работы: Пн: c 08:30-17:30, Вт: c 08:30-17:30, Ср: c 08:30-17:30, Чт: c 08:30-17:30, Пт: c 08:30-17:30, Сб: выходной, Вс: выходной

25.01.2023 13:21

Группа Вахрушева – Копенгагенский университет

Кафедра сотовой связи и
Молекулярная медицина

Научные исследования Группы Вахрушева направлены на полнопротеомную характеристику структур О-гликанов в определенных участках О-гликопротеинов.

Посттрансляционные модификации (ПТМ) обеспечивают практически безграничное расширение структурного пространства протеома организма и усложняют интерактом. Гликозилирование белков, возможно, является наиболее распространенным и, безусловно, наиболее разнообразным PTM. Из двух основных классов гликозилирования — происходящих по остаткам Asn (N-связанные) и по остаткам Ser, Thr или Tyr (O-связанные) — О-гликозилирование муцинового типа (GalNAc-типа) является наиболее разнообразным. и дифференцированно регулируемый и все же наименее понятый. Сайт-специфическое O-гликозилирование становится важной концепцией для регуляции процессинга и функций белков. Однако полное понимание природы и функций этого распространенного типа белкового гликозилирования сильно затруднено из-за отсутствия инструментов и методов для полнопротеомной характеристики структур O-гликанов в специфических участках O-гликопротеинов.

В области O-гликопротеомики анализ структур гликанов уже достаточно хорошо изучен, в то время как локализация и количественная оценка O-гликанов на отдельных сайтах белков по-прежнему сопряжены со значительными трудностями.

A) Схематическое изображение стратегии SimpleCell. Нокаут COSMC POMGNT1 приводит к упрощенному гликозилированию O-GalNAc или NeuAcα2-6GalNAc (в некоторых клетках). B) Стратегия обогащения гликопептидов O-GalNAc с помощью агглютинина Vicia villosa (VVA) с помощью слабоаффинной хроматографии (LWAC) на лектине и гликопептидов Gal(b1-3)GalNAc с помощью агглютинина арахиса (PNA) или жакалина. C) Схема рабочего процесса гликопротеомики. Гликопептиды O-GalNAc подвергали nLC-MS (OrbiTrap) с последующим повторным анализом 5 лучших HCD MS2 и 5 лучших ETD MS2. D) Анализ O-гликопротеома CHO WT. Сравнительный анализ подмножества O-гликозитов триптического перевара, идентифицированного в CHO SC (слева), и триптического перевара CHO WT (справа). Д) Пример анализа О-гликопротеома биожидкостей (моча и плазма человека) и образцов тканей (мозг мыши).

Гликопротеомика следующего поколения
Основное препятствие связано с двумя фундаментальными проблемами: 1) преодолеть трудности одновременной идентификации и количественного определения структур нативных гликанов и стоихантометрии на одиночных гликозитах и ​​купажи; особенно в сложной матрице.

Рабочий процесс гликопротеомики следующего поколения, основанный на стратегиях гликопротеома SimpleCell для решения задач разработки того, что станет следующим прорывом в протеомике PTM, а именно гликопротеомики с высокой пропускной способностью. это 9Подход 0003 должен позволять проводить скрининг сложных образцов при одновременной идентификации нативных гликоструктур и гликозитов. Следующим шагом для продвижения стратегии количественной гликопротеомики будет разработка высокопроизводительных протоколов для определения занятости сайта гликозилирования. Мы сможем одновременно сообщать о локализации сайта и в то же время определять стехиометрию гликозилирования и исследовать динамику гликозилирования. Более широкое применение этих стратегий должно расширить наши знания о различных гликопротеомах и открыть для открытия биологические функции в норме и при болезни. Таким образом, эта стратегия должна оказать существенное влияние на область клеточной биологии и даже в более широком смысле на биомедицину. Более того, предложенная стратегия, вероятно, будет весьма применима для других типов гликозилирования белков и, в более общем смысле, для др. сложных посттрансляционных модификаций.

Гликозилирование тирозина O-GalNAc
Наряду с расширением O-гликопротеома новым интересным событием стало открытие присоединения GalNAc к остаткам тирозина . В настоящее время мы идентифицировали в общей сложности более 150 Tyr O-гликозитов. В настоящее время наше понимание биологии этой новой модификации внеклеточных белков ограничено, и первым шагом является дальнейшее определение этого подмножества гликопротеома O-GalNAc. Однако недавно фосфорилирование остатков Tyr на мембранных белках было идентифицировано на многих из тех же белков в непосредственной близости от того места, где мы идентифицировали гликозиты GalNAc-Tyr (Bordoli M.L. et al. Cell 2014). Цель состоит в том, чтобы разработать протокол для селективного обогащения О-гликопептидов GalNAc-Tyr и дальнейшего расширения этого О-гликопротеома. Пока неизвестно, контролируют ли ферменты полипептида GalNAc-T это гликозилирование или другие неизвестные ферменты, но можно предположить возможность перекрестного взаимодействия между фосфорилированием и гликозилированием типа GalNAc по остаткам тирозина.

Клиническая гликопротеомика
Аберрантное гликозилирование происходит при развитии рака. При О-гликозилировании это приводит к укорочению О-гликоструктур в сторону структуры NeuAc-GalNAc (SiaTn-эпитоп). В результате повышающая регуляция SiaTn-гликопептидов может служить источником потенциальных биомаркеров. Согласно замыслу проекта, платформа гликопротеомики нового поколения должна быть расширена и применена для исследования аберрантного гликозилирования в биологических жидкостях человека (плазма, моча) и тканях (печень, почка, мозг) пациента, а также в качестве новаторского инструмента в клинических исследованиях.

Вычислительная гликопротеомика и гликоинформатика
Современная протеомика и масс-спектрометрия требуют интеграции сильной биоинформатики и программирования. В области гликопротеомики по-прежнему не хватает надежных инструментов информатики, особенно для приложений с высокой пропускной способностью. Целью является дальнейшее развитие и совершенствование алгоритмов масс-спектрометрии на основе гликопротеомики.

• Стентофт, С. , Вахрушев, С.Ю., Беннетт, Э.П., Вестер-Кристенсен, М.Б., и      Клаузен, Х. Добыча O-гликопротеома с использованием линий SimpleCell, сконструированных с помощью цинковых пальцев      нуклеазно-гликоинженерных. Нац. Методы , 2011, 8(11):977-982
• Стентофт С., Вахрушев С.Ю., Джоши Х.Дж., Конг Ю., Вестер-Кристенсен М.Б., Шьолдагер КТГ, Лаврсен К., Дабельстин С., Педерсен Н.Б., Маркос-Сильва Л., Гупта Р., Беннетт Э.П., Мандель У., Вандалл Х., Брунак С., Левери С.Б., Клаузен Х. (2013) Точное картирование человеческого О-гликопротеома типа GalNAc – взгляд первого поколения из 12 простых клеток человека. EMBO J 32(10):1478-88
• Вестер-Кристенсен М.Б., Халим А., Джоши Х.Дж., Стинтофт С., Беннетт Э.П., Левери С.Б., Вахрушев С.Ю., Клаузен Х (2013)  Изучение гликопротеома О-маннозы выявило кадгерины как основные О-маннозилированные гликопротеины. Proc Natl Acad Sci USA  110(52):21018-23

• Левери С.Б. , Стинтофт С., Халим А.Х., Наримацу Ю., Клаузен Х., Вахрушев С.Ю. Достижения в масс-спектрометрии на основе O-гликопротеомики Biochim Biophys Acta. 2015, 1850(1): 33-42.

• Ян З., Ван С., Халим А., Шульц М.А., Фродин М., Рахман С.Х., Вестер-Кристенсен М.Б., Беренс С., Кристенсен С., Вахрушев С.Ю., Беннетт Э.П., Вандалл Х.Х., Клаузен Х. (2015) Сконструированные клетки CHO для производства разнообразных гомогенных гликопротеинов. Nat Biotechnol 33(8):842-4
• Кампос Д., Фрейтас Д., Гомеш Дж., Магалхаес А., Стентофт С., Гомеш С., Вестер-Кристенсен М.Б., Феррейра Дж.А., Афонсу Л.П., Сантос Л.Л., де Соуза Дж.П., Мандель У., Клаусен Х., Вахрушев С.Ю., Рейс К.А. Исследование O-гликопротеома клеточных линий желудка для обнаружения биомаркеров. Мол. Сотовый Протеом . 2015, 14(6): 1616-29
• Хетарпал С.А., Шьолдагер КТГ, Кристофферсен С., Рагхаван А., Эдмондсон А.С., Рейтер Х.М., Ахмед Б., Уццани Р. , Пелосо Г.М., Виталий С., Чжао В., Варшини А., Миллар Дж.С., Парк Ю., Фернандо Г., Ливанов В., Чой С., Ноэ Э., Патель П., Хо С., Глобальный консорциум по генетике липидов, Кирхгесснер Т.Г., Вандалл Х.Х., Хансен Л., Беннетт Э.П., Вахрушев С.Ю., Салехин Д., Катиресан С., Браун К.Д., Джамра А.Б., ЛеГерн Э., Клаузен Х., Рейдер диджей. (2016) Потеря функции GALNT2 снижает уровень липопротеинов высокой плотности у людей, приматов и грызунов. Метаболизм клеток  24(2):234-45.
• Larsen ISB, Narimatsu Y, Joshi HJ, Yang Z, Harrison OJ, Brasch J, Shapiro L, Honig B, Vakhrushev SY, Clausen H, Halim A. (2017) O-маннозилирование кадгеринов и плексинов у млекопитающих не зависит от белка O -маннозилтрансфераза 1 и 2. J Biol Chem  292(27):11586-11598
• Ларсен ISB, Наримацу Ю., Джоши Х.Дж., Сьюстайте Л., Харрисон О.Дж., Браш Дж., Гудман К., Хансен Л., Шапиро Л., Хониг Б., Вахрушев С.Ю., Клаусен Х., Халим А. (2017) Открытие романа О-маннозилирование путь, избирательно обслуживающий кадгерины и протокадгерины. Proc Natl Acad Sci USA  114(42):11163-11168

• Рамон Уртадо-Герреро, Сарагоса
• Леонор Давид, Порту
• Селсо Рейс, Порту
• Фред Бард, Сингапур
• Тим Рождественский, Мюнстер
• Питер Бродерсен, Копенгаген
• Янош Терзич, Сплит
• Андреа Урбани, Рим
• Карл Мехтлер, Вена
• Лэнс Уэллс, Афины, США

• Датский национальный исследовательский фонд
• Фонд Лундбек
• АП Меллер
• Национальный институт здравоохранения
• ЕС

Лидер группы

Sergey Vakhrushev
Доцент
[email protected]

(+45) 35 32 77 85 / (+45) 23 84 01 54
CV, публикация, ETC

Программа Glycomics
Копенгагенский центр Glycomics 

Преподаватели и сертифицированные поставщики | Школа медицины

Языки общения:

Академическая информация

Отделы: Биохимия – Доцент-исследователь

Информация об академическом офисе

Oliver. [email protected]

(801) 213-0783

Emma Eccles Jones Medical Research Building

15 N Medical Dr E, Комната:
Солт-Лейк-Сити, Юта

История образования

Избранные публикации

1. Браш Дж., Кацамба П.С., Харрисон О.Дж. , Алсн Г., Трояновский Р.Б., Индра И., Качинская А., Кесер Б., Трояновский С., Хониг Б., Шапиро Л. (2017). Гомофильные и гетерофильные взаимодействия кадгеринов II типа позволяют выявить группы специфичности, лежащие в основе клеточно-адгезивного поведения. Cell Rep , 23 (6), 1840-1852.
2. Евангелиста Ф. , Рот А.Дж., Присаян П., Темпл Б.Р., Ли Н., Цянь Ю., Калтон Д.А., Лю З., Харрисон О.Дж. , Браш Дж., Хониг Б., Шапиро Л., Диас Л.А. (2018). Патогенные аутоантитела IgG4 из эндемической листовидной пузырчатки распознают конформационный эпитоп десмоглеина-1. J Аутоиммун , 89 , 171-185.
3. Ларсен ISB, Наримацу Ю., Джоши Х.Дж., Сиукштайте Л., Harrison OJ , Brasch J, Goodman KM, Hansen L, Shapiro L, Honig B, Vakhrushev SY, Clausen H, Halim A (2017). Открытие пути O-маннозилирования, избирательно обслуживающего кадгерины и протокадгерины. Proc Natl Acad Sci USA , 114 (42), 11163-11168.
4. Larsen ISB, Narimatsu Y, Joshi HJ, Yang Z, Harrison OJ , Brasch J, Shapiro L, Honig B, Vakhrushev SY, Clausen H, Halim A (2017). О-маннозилирование кадгеринов и плексинов у млекопитающих не зависит от протеинов О-маннозилтрансфераз 1 и 2. J Biol Chem , 292 (27), 11586-11598.
5. Harrison OJ , Браш Дж., Лассо Г., Кацамба П.С., Альсен Г., Хониг Б., Шапиро Л. (2016). Структурные основы адгезивного связывания десмоколлинами и десмоглеинами. Proc Natl Acad Sci USA , 113 (26), 7160-5.
6. Biswas KH, Hartman KL, Yu CH, Harrison OJ , Song H, Smith AW, Huang WY, Lin WC, Guo Z, Padmanabhan A, Troyanovsky SM, Dustin ML, Shapiro L, Honig B, Zaidel-Bar R, Groves Дж. Т. (2015). Образование соединения E-кадгерина включает активный кинетический процесс нуклеации. Proc Natl Acad Sci USA , 112 (35), 10932-7.
7. Vendome J, Felsovalyi K, Song H, Yang Z, Jin X, Brasch J, Harrison OJ , Альсен Г., Бана Ф., Качинска А., Кацамба П.С., Эдмонд Д., Хаббелл В.Л., Шапиро Л., Хониг Б. (2014). Структурные и энергетические детерминанты специфичности связывания адгезива в кадгеринах I типа. Proc Natl Acad Sci USA , 111 (40), E4175-84.
8. Harrison OJ , Vendome J, Brasch J, Jin X, Hong S, Katsamba PS, Ahlsen G, Troyanovsky RB, Troyanovsky SM, Honig B, Shapiro L (2012). Структуры эктодомена нектина обнаруживают канонический адгезивный интерфейс. Nat Struct Mol Biol , 19 (9), 906-15.
9. Браш Дж. , Харрисон О.Дж. , Хониг Б., Шапиро Л. (2012). Мышление вне клетки: как кадгерины управляют адгезией. Trends Cell Biol , 22 (6), 299-310.
10. Браш Дж., Харрисон О.Дж. , Альсен Г., Лю К., Шапиро Л. (2011). Кристаллическая структура лиганд-связывающего домена нетрина G2. J Mol Biol , 414 (5), 723-34.
11. Браш Дж., Харрисон О.Дж. , Альсен Г., Карналли С.М., Хендерсон Р.М., Хониг Б., Шапиро Л. (2011). Структура и механизм связывания эндотелиального кадгерина сосудов: расходящийся классический кадгерин. Дж Мол Биол , 408 (1), 57-73.
12. Harrison OJ , Jin X, Hong S, Bahna F, Ahlsen G, Brasch J, Wu Y, Vendome J, Felsovalyi K, Hampton CM, Troyanovsky RB, Ben-Shaul A, Frank J, Troyanovsky SM, Shapiro L, Honig Б (2010). Внеклеточная архитектура слипчивых контактов выявляется по кристаллическим структурам кадгеринов I типа. Структура , 19 (2), 244-56.
13. У И, Джин Х, Харрисон О , Шапиро Л., Хониг Б.Х., Бен-Шаул А. (2010). Кооперативность между транс- и цис-взаимодействиями в образовании соединения, опосредованного кадгерином. Proc Natl Acad Sci USA , 107 (41), 17592-7.
14. Harrison OJ , Bahna F, Katsamba PS, Jin X, Brasch J, Vendome J, Ahlsen G, Carroll KJ, Price SR, Honig B, Shapiro L (2010). Двухэтапное адгезивное связывание классическими кадгеринами. Nat Struct Mol Biol , 17 (3), 348-57.
15. Ciatto C, Bahna F, Zampieri N, VanSteenhouse HC, Katsamba PS, Ahlsen G, Harrison OJ , Brasch J, Jin X, Posy S, Vendome J, Ranscht B, Jessell TM, Honig B, Shapiro L (2010).